More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_23270 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_23270  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  100 
 
 		 411 aa  826    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23240  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  49.88 
 
 		 415 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.9 
 
 		 419 aa  150  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23260  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.04 
 
 		 419 aa  150  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 830 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2530  hypothetical protein  26.18 
 
 		 407 aa  125  9e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0995274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1801  protein of unknown function DUF214  26.49 
 
 		 412 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  29.06 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  28.05 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  27.3 
 
 		 422 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  26.08 
 
 		 406 aa  116  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  27.23 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3444  putative ABC transporter permease protein  25.54 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0182994  normal  0.122472 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0369  hypothetical protein  27.19 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  25.73 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2438  hypothetical protein  27.43 
 
 		 406 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  24.08 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  29.57 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2373  ABC-type transport system, permease component  22.44 
 
 		 407 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000351897  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1622  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  24.93 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  22.73 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2395  hypothetical protein  24.24 
 
 		 404 aa  101  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.111806  normal  0.574816 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001464  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  25.82 
 
 		 409 aa  101  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  27.83 
 
 		 389 aa  99.8  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7413  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.3 
 
 		 405 aa  99.8  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.155043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3197  hypothetical protein  24.68 
 
 		 427 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2374  ABC-type transport system, permease component  21.9 
 
 		 409 aa  97.4  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000200206  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2020  protein of unknown function DUF214  24.51 
 
 		 411 aa  96.7  8e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000619382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2498  hypothetical protein  22.93 
 
 		 380 aa  94.7  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00553555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  23.53 
 
 		 411 aa  93.6  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1430  hypothetical protein  22.27 
 
 		 428 aa  93.6  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1621  protein of unknown function DUF214  24.78 
 
 		 404 aa  93.2  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  24.93 
 
 		 429 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2749  hypothetical protein  24.66 
 
 		 409 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0349567  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19660  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.36 
 
 		 400 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.48 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.34 
 
 		 416 aa  90.1  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  20.62 
 
 		 410 aa  90.1  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2660  hypothetical protein  24.79 
 
 		 410 aa  89.7  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2475  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.74 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.566414  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2783  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  22.81 
 
 		 415 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0629713  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0370  hypothetical protein  25.12 
 
 		 409 aa  88.2  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1293  efflux ABC transporter, permease protein  23.12 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0917  hypothetical protein  27.47 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  26.3 
 
 		 441 aa  87.8  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6004  hypothetical protein  25.73 
 
 		 405 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  21.63 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.48 
 
 		 416 aa  87.4  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2535  protein of unknown function DUF214  24.34 
 
 		 412 aa  87  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.49 
 
 		 424 aa  86.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1547  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.35 
 
 		 417 aa  86.3  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124688  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  23.32 
 
 		 409 aa  85.9  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05402  hypothetical protein  21.05 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5639  hypothetical protein  25.51 
 
 		 387 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29500  hypothetical protein  24.79 
 
 		 416 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2394  hypothetical protein  23.22 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.48898  normal  0.587335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1429  hypothetical protein  24.38 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0137  putative permease  22.22 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2529  lipoprotein releasing system, transmembrane protein LolE  21.76 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1240  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  21.76 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00286068  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1240  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  21.76 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0067716  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.5 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1498  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  21.51 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00176563  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2483  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  21.76 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00147297  normal  0.0550252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2008  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  21.51 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0630458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1650  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  22.19 
 
 		 415 aa  84  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2205  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  21.76 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.37 
 
 		 414 aa  83.6  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  21.15 
 
 		 422 aa  84  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.52 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2903  hypothetical protein  24.94 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.110934 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01114  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  21.51 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01122  hypothetical protein  21.51 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.15 
 
 		 416 aa  82.8  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.132324 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.19 
 
 		 434 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3275  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.19 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25.65 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2598  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.41 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1633  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  21.13 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1620  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.72 
 
 		 415 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.356134  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0081  hypothetical protein  26.64 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.466459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4530  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.55 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1472  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  22.36 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0435  hypothetical protein  20.28 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.131989  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  22.8 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  20.65 
 
 		 414 aa  80.9  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  20.62 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1229  hypothetical protein  23.44 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.965608  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2346  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.41 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.323587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.41 
 
 		 422 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.35 
 
 		 439 aa  79.7  0.00000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3479  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  23.49 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.640884  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.1 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.26 
 
 		 426 aa  79.3  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.172929  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2154  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.71 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3974  protein of unknown function DUF214  26.09 
 
 		 952 aa  79.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1365  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.71 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1765  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.01 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.157209  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  24.72 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>