81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1978 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  911    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1623  hypothetical protein  35.78 
 
 		 514 aa  260  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.132347  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5456  hypothetical protein  27.44 
 
 		 475 aa  138  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2558  ABC transporter, permease protein  27.5 
 
 		 474 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308598 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2758  permease, putative  26.61 
 
 		 475 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  25.68 
 
 		 470 aa  130  6e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2419  hypothetical protein  26.39 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0619  peptide ABC transporter permease  28.51 
 
 		 491 aa  84.7  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  22.07 
 
 		 505 aa  84.7  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0438  peptide ABC transporter permease  25.95 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1558  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  25.52 
 
 		 468 aa  70.1  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.457306  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0613  transmembrane protein Vexp1  22.44 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0615  transmembrane protein Vexp3  23.55 
 
 		 458 aa  67  0.0000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1142  efflux ABC transporter, permease protein  24.53 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2080  transmembrane protein Vexp1  23.04 
 
 		 425 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  23.28 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2078  transmembrane protein Vexp3  23.9 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0226824  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1013  lipoprotein release ABC transporter permease  21.7 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1143  efflux ABC transporter, permease protein  24.37 
 
 		 456 aa  56.2  0.000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  22.29 
 
 		 464 aa  56.2  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  24.89 
 
 		 484 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5641  hypothetical protein  22.1 
 
 		 780 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.735155  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0680  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 809 aa  53.5  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  27.87 
 
 		 1090 aa  50.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  21.61 
 
 		 484 aa  50.4  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  23.16 
 
 		 805 aa  50.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  21.51 
 
 		 851 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.33 
 
 		 437 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1798  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 		 953 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0276  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 		 963 aa  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  22.12 
 
 		 424 aa  47.8  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  22.14 
 
 		 408 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  33.33 
 
 		 386 aa  47.8  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  20.73 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  24.49 
 
 		 1016 aa  47.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  21.15 
 
 		 880 aa  47.4  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 386 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  26.8 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  27.27 
 
 		 903 aa  47.4  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  31.62 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2259  protein of unknown function DUF214  22.61 
 
 		 379 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241243  normal  0.64676 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  22.12 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 420 aa  46.6  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  22.79 
 
 		 790 aa  46.6  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 		 800 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  24.24 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  32 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  31.82 
 
 		 702 aa  46.2  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.863248 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  41.56 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  34.23 
 
 		 859 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  32 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  27.22 
 
 		 950 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  32 
 
 		 386 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  21.05 
 
 		 412 aa  45.8  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 		 930 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  20.6 
 
 		 379 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  24.02 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 		 852 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  24.02 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1014  lipoprotein release ABC transporter permease  23.58 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2083  protein of unknown function DUF214  20.3 
 
 		 797 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  22.18 
 
 		 409 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0277  protein of unknown function DUF214  23.2 
 
 		 431 aa  43.9  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  24.08 
 
 		 861 aa  44.3  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  25.94 
 
 		 429 aa  44.3  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  29.25 
 
 		 417 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.61 
 
 		 386 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1981  permease domain-containing protein  42.62 
 
 		 364 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  22.39 
 
 		 402 aa  43.9  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  35.14 
 
 		 386 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26210  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.36 
 
 		 919 aa  43.9  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.443044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  27.73 
 
 		 409 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  20.75 
 
 		 804 aa  43.5  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1336  hypothetical protein  21.37 
 
 		 454 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.420659  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  28.37 
 
 		 662 aa  43.1  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  24.21 
 
 		 406 aa  43.1  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  20 
 
 		 855 aa  43.1  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0718  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 		 424 aa  43.1  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  21.97 
 
 		 853 aa  43.1  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  24.39 
 
 		 643 aa  43.1  0.01  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>