33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0619 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0619  peptide ABC transporter permease  100 
 
 		 491 aa  957    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0438  peptide ABC transporter permease  54.91 
 
 		 485 aa  442  1e-123  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  43.6 
 
 		 505 aa  297  3e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2758  permease, putative  29.68 
 
 		 475 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213868  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5456  hypothetical protein  29.25 
 
 		 475 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2558  ABC transporter, permease protein  28.94 
 
 		 474 aa  192  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308598 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  28.09 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2419  hypothetical protein  28.01 
 
 		 478 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  24.02 
 
 		 451 aa  108  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1013  lipoprotein release ABC transporter permease  27.51 
 
 		 406 aa  90.9  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1623  hypothetical protein  25.51 
 
 		 514 aa  89.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.132347  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0615  transmembrane protein Vexp3  26.71 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2078  transmembrane protein Vexp3  26.46 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0226824  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1142  efflux ABC transporter, permease protein  24.65 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0613  transmembrane protein Vexp1  21.9 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  29.55 
 
 		 484 aa  70.1  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1558  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.92 
 
 		 468 aa  69.3  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.457306  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0682  permease, putative  23.93 
 
 		 409 aa  69.7  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  30.08 
 
 		 484 aa  66.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2080  transmembrane protein Vexp1  22.95 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  23.98 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1143  efflux ABC transporter, permease protein  23.5 
 
 		 456 aa  62.8  0.00000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1014  lipoprotein release ABC transporter permease  21.79 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  23.38 
 
 		 408 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2446  hypothetical protein  28.32 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0214415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1665  ABC transporter, permease protein, putative  25.11 
 
 		 420 aa  45.8  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  22.9 
 
 		 792 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3804  protein of unknown function DUF214  34.72 
 
 		 378 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2448  hypothetical protein  25.38 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0464598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 		 409 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  26.91 
 
 		 378 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  24.71 
 
 		 409 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>