178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2446 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2446  hypothetical protein  100 
 
 		 479 aa  909    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0214415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2448  hypothetical protein  48.92 
 
 		 438 aa  328  9e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0464598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5451  protein of unknown function DUF214  38.39 
 
 		 511 aa  246  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289306  normal  0.390939 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1311  protein of unknown function DUF214  42.46 
 
 		 468 aa  239  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.141465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  28.39 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  25.65 
 
 		 651 aa  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0856  ABC transporter, permease protein, putative  28.12 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0945492  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  23.85 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  30.83 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  22.37 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  25.99 
 
 		 464 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  24.65 
 
 		 386 aa  62  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  26.41 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  29.22 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  26.68 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1393  protein of unknown function DUF214  26.89 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.127841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  24.32 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25 
 
 		 387 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  26.62 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  25.34 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  21.94 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  24.59 
 
 		 386 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  21.39 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  25.32 
 
 		 404 aa  58.9  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  29.87 
 
 		 401 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  27.68 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  26.01 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  23.61 
 
 		 652 aa  57.4  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  30.35 
 
 		 484 aa  57  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  22.33 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  27.81 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  25.67 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  25.81 
 
 		 399 aa  54.7  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  27.04 
 
 		 389 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  23.01 
 
 		 409 aa  55.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  24.05 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  22.61 
 
 		 413 aa  54.7  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.48 
 
 		 386 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.53 
 
 		 385 aa  54.3  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  23.41 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.75 
 
 		 371 aa  53.9  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  24.46 
 
 		 386 aa  53.5  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  23.41 
 
 		 404 aa  53.9  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1714  hypothetical protein  24.7 
 
 		 791 aa  53.1  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  26.21 
 
 		 421 aa  53.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  26.55 
 
 		 666 aa  53.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.61 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  23.29 
 
 		 386 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  27.59 
 
 		 410 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0223  hypothetical protein  26.02 
 
 		 401 aa  52.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  29.17 
 
 		 393 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  29.35 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3708  ABC transporter permease protein  26.55 
 
 		 399 aa  52.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  23.88 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  28.92 
 
 		 853 aa  51.6  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.11 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1376  hypothetical protein  25.22 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  20.57 
 
 		 664 aa  51.6  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  24.88 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  24.01 
 
 		 402 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  24.48 
 
 		 421 aa  51.2  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  25.79 
 
 		 404 aa  51.2  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2964  protein of unknown function DUF214  30.12 
 
 		 415 aa  51.2  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036613 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0774  hypothetical protein  27.32 
 
 		 407 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.98334  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  25.1 
 
 		 405 aa  50.8  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  24.74 
 
 		 401 aa  50.4  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  27.72 
 
 		 484 aa  50.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  29.53 
 
 		 395 aa  50.8  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  25.45 
 
 		 505 aa  50.4  0.00007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  23.98 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.13 
 
 		 882 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2608  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 395 aa  50.1  0.00009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0281  ABC transporter, permease protein, putative  20.83 
 
 		 458 aa  50.1  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  23.6 
 
 		 407 aa  50.1  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  29.66 
 
 		 411 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  23.69 
 
 		 409 aa  50.1  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  22.5 
 
 		 415 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.43 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  22.55 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  23.55 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  20.91 
 
 		 398 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  24.4 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  23.91 
 
 		 849 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  22.53 
 
 		 406 aa  49.3  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  21.7 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  24.71 
 
 		 420 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  24.89 
 
 		 413 aa  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  26.69 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  29.15 
 
 		 848 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  30.57 
 
 		 406 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.89 
 
 		 406 aa  48.5  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  25.54 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 		 401 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3478  protein of unknown function DUF214  28.21 
 
 		 402 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.12 
 
 		 412 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0619  peptide ABC transporter permease  27.63 
 
 		 491 aa  48.1  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2535  hypothetical protein  36.84 
 
 		 931 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0441997  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  25.72 
 
 		 488 aa  48.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>