184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5451 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5451  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
511 aa  971    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289306  normal  0.390939 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1311  protein of unknown function DUF214  44.42 
 
 
468 aa  279  7e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.141465  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2446  hypothetical protein  39.31 
 
 
479 aa  267  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0214415  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2448  hypothetical protein  35.38 
 
 
438 aa  236  7e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0464598  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  26.98 
 
 
414 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  32.06 
 
 
387 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  25.93 
 
 
464 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  27.44 
 
 
371 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  27.19 
 
 
397 aa  63.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.38 
 
 
385 aa  62.4  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  30.96 
 
 
391 aa  60.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  30.34 
 
 
852 aa  60.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
405 aa  60.5  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  31.11 
 
 
398 aa  60.5  0.00000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  29.78 
 
 
406 aa  60.1  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  26.94 
 
 
653 aa  58.9  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  25.22 
 
 
408 aa  58.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  27.47 
 
 
462 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  27.23 
 
 
868 aa  57.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  23.18 
 
 
387 aa  57.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25 
 
 
406 aa  57.4  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  29.19 
 
 
389 aa  57  0.0000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 
403 aa  57  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  25.53 
 
 
402 aa  57  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  31.22 
 
 
385 aa  56.6  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  26.18 
 
 
404 aa  56.2  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  26.18 
 
 
404 aa  56.2  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  30.04 
 
 
394 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  30.11 
 
 
484 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  25.93 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  44.59 
 
 
462 aa  55.8  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  32.61 
 
 
848 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25 
 
 
386 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.54 
 
 
413 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  26.61 
 
 
386 aa  53.5  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  23.72 
 
 
395 aa  53.5  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  28.63 
 
 
395 aa  53.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1376  hypothetical protein  32.75 
 
 
386 aa  53.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.82 
 
 
408 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  21.12 
 
 
415 aa  53.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0774  hypothetical protein  26.76 
 
 
407 aa  53.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.98334  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  23.81 
 
 
395 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4337  hypothetical protein  28.76 
 
 
876 aa  53.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412663  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  29.9 
 
 
402 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  24.34 
 
 
404 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  27.45 
 
 
404 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  28.71 
 
 
399 aa  52  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2215  protein of unknown function DUF214  29.39 
 
 
402 aa  52  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.556165  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2542  hypothetical protein  30.34 
 
 
441 aa  52  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.429279  normal  0.740963 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  25.91 
 
 
411 aa  52  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  24.15 
 
 
405 aa  51.6  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.7 
 
 
863 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_002936  DET0856  ABC transporter, permease protein, putative  24.83 
 
 
407 aa  51.6  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0945492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  24.35 
 
 
386 aa  51.6  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  27.8 
 
 
407 aa  51.2  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  36.76 
 
 
779 aa  51.6  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0797  hypothetical protein  26.77 
 
 
488 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1336  hypothetical protein  27.48 
 
 
454 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.420659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  28.64 
 
 
861 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0187  hypothetical protein  27.69 
 
 
364 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  27.62 
 
 
395 aa  51.2  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 
397 aa  50.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  25.19 
 
 
657 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  27.91 
 
 
409 aa  50.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0746  ABC transporter, permease protein  22.92 
 
 
1132 aa  50.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.749674  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  35.16 
 
 
1143 aa  50.4  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.52 
 
 
412 aa  50.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  21.74 
 
 
414 aa  50.1  0.00009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  27.31 
 
 
869 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0729  ABC transporter, permease protein, putative  21.88 
 
 
1132 aa  49.7  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  22.92 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  19.77 
 
 
414 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  30.5 
 
 
884 aa  49.7  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  22.51 
 
 
393 aa  49.7  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  25.94 
 
 
505 aa  48.9  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  27.51 
 
 
408 aa  49.3  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  26.22 
 
 
401 aa  49.3  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.46 
 
 
1207 aa  48.9  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  27.76 
 
 
656 aa  48.5  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  33.61 
 
 
664 aa  48.5  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26210  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  31.5 
 
 
919 aa  48.5  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.443044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  26.44 
 
 
414 aa  48.5  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  24.75 
 
 
643 aa  48.5  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  24.89 
 
 
402 aa  48.1  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  22.51 
 
 
376 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  29.37 
 
 
1130 aa  47.8  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  28.11 
 
 
402 aa  47.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  28.11 
 
 
402 aa  47.8  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  24.57 
 
 
406 aa  47.4  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  27.05 
 
 
411 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 
406 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  30.07 
 
 
443 aa  47  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  27.48 
 
 
413 aa  47.4  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.4 
 
 
413 aa  47  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.48 
 
 
411 aa  47  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  27.49 
 
 
410 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  25.49 
 
 
657 aa  47  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2964  protein of unknown function DUF214  46.27 
 
 
415 aa  47  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036613 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  27.91 
 
 
873 aa  47  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  27.8 
 
 
825 aa  47  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>