More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0476 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  59.76 
 
 
660 aa  750    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  100 
 
 
664 aa  1345    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  50.52 
 
 
662 aa  659    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  48.73 
 
 
664 aa  591  1e-167  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  34.23 
 
 
643 aa  346  8e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  32.01 
 
 
642 aa  281  2e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  31.25 
 
 
652 aa  266  1e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  31.2 
 
 
652 aa  264  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  30.26 
 
 
668 aa  261  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  30.29 
 
 
647 aa  261  4e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  30.32 
 
 
649 aa  259  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.28 
 
 
656 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  30.26 
 
 
656 aa  257  4e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  31.71 
 
 
647 aa  257  5e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  29.99 
 
 
650 aa  254  5.000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  29.02 
 
 
667 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  29.02 
 
 
667 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  29.84 
 
 
696 aa  250  6e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  31.11 
 
 
647 aa  249  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  30.47 
 
 
648 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  30.32 
 
 
657 aa  249  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  30.47 
 
 
648 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  28.2 
 
 
653 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.08 
 
 
648 aa  247  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  29.13 
 
 
653 aa  245  9.999999999999999e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  44.03 
 
 
779 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.38 
 
 
678 aa  245  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  29.38 
 
 
678 aa  245  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  29.38 
 
 
678 aa  245  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0097  macrolide-specific ABC-type efflux carrier MacB  29.64 
 
 
668 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  29.75 
 
 
643 aa  243  7.999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  30.45 
 
 
640 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.04 
 
 
888 aa  240  5e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  30.25 
 
 
650 aa  240  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.34 
 
 
665 aa  239  8e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1297  ABC transporter related  30.62 
 
 
652 aa  239  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  30.32 
 
 
648 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.03 
 
 
648 aa  238  2e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.46 
 
 
648 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  30.32 
 
 
648 aa  238  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.32 
 
 
648 aa  238  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  28.7 
 
 
655 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  30.32 
 
 
648 aa  238  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.32 
 
 
648 aa  238  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  30.17 
 
 
648 aa  237  6e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  28.63 
 
 
646 aa  236  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  28.82 
 
 
657 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  29 
 
 
656 aa  234  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  29.26 
 
 
671 aa  233  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  44.19 
 
 
1090 aa  231  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  44.24 
 
 
779 aa  232  2e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  27.51 
 
 
657 aa  231  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2115  ABC transporter related  30.2 
 
 
647 aa  230  8e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  27.25 
 
 
666 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  47.37 
 
 
950 aa  229  2e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  43.41 
 
 
1130 aa  227  4e-58  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  28.84 
 
 
660 aa  225  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  29.01 
 
 
641 aa  222  1.9999999999999999e-56  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  29.73 
 
 
668 aa  222  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  29.73 
 
 
668 aa  222  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  28.97 
 
 
641 aa  221  3.9999999999999997e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  50.64 
 
 
1207 aa  220  7e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  28.68 
 
 
641 aa  219  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  47.5 
 
 
903 aa  216  8e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  28.76 
 
 
654 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  46.88 
 
 
226 aa  213  9e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  45.68 
 
 
885 aa  212  2e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  28.1 
 
 
670 aa  211  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  46.09 
 
 
230 aa  210  7e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  47.37 
 
 
233 aa  210  9e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  43.7 
 
 
236 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  45.13 
 
 
238 aa  208  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  38.24 
 
 
651 aa  207  7e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  45.41 
 
 
234 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  28.72 
 
 
650 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  44.8 
 
 
230 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  46.09 
 
 
230 aa  204  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  26.52 
 
 
707 aa  204  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0369  ABC transporter related  45.41 
 
 
234 aa  204  4e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.548641  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  46.85 
 
 
233 aa  204  5e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  37.66 
 
 
715 aa  204  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  44.89 
 
 
228 aa  203  7e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  45.41 
 
 
234 aa  203  9e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2771  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 
223 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  47.56 
 
 
319 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  36.57 
 
 
656 aa  201  3e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  45.13 
 
 
260 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  43.69 
 
 
235 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  44.25 
 
 
228 aa  201  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  44.05 
 
 
230 aa  201  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  46.61 
 
 
223 aa  200  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  37.1 
 
 
653 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  35.76 
 
 
663 aa  200  7e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  38.28 
 
 
652 aa  200  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  48.17 
 
 
222 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  39.67 
 
 
646 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  36.04 
 
 
654 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  46.61 
 
 
223 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  47.51 
 
 
241 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  46.61 
 
 
223 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>