More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2096 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  100 
 
 
464 aa  910    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  35.37 
 
 
484 aa  156  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  34.01 
 
 
484 aa  150  4e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2419  hypothetical protein  27.74 
 
 
478 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2558  ABC transporter, permease protein  24.23 
 
 
474 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308598 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5456  hypothetical protein  24.94 
 
 
475 aa  87.4  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2758  permease, putative  24.17 
 
 
475 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213868  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2748  putative lipoprotein releasing system transmembrane  27.38 
 
 
418 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  23.27 
 
 
470 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.88 
 
 
386 aa  71.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1528  hypothetical protein  25.2 
 
 
409 aa  70.1  0.00000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.275544 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.09 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.94 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.59 
 
 
418 aa  69.3  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  27.32 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0682  permease, putative  25.25 
 
 
409 aa  69.3  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  26.42 
 
 
397 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0856  protein of unknown function DUF214  24.31 
 
 
417 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0205588  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  25.75 
 
 
397 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.37 
 
 
415 aa  66.6  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  25.17 
 
 
397 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  31.38 
 
 
397 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2639  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.6 
 
 
417 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.34 
 
 
424 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2584  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.6 
 
 
417 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.297179  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.2 
 
 
416 aa  65.1  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3231  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.48 
 
 
422 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113164  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5136  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.48 
 
 
422 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433144  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.69 
 
 
414 aa  64.7  0.000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  20.69 
 
 
414 aa  64.7  0.000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.51 
 
 
421 aa  64.3  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  25.14 
 
 
662 aa  64.3  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.87 
 
 
852 aa  64.3  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  26 
 
 
397 aa  63.9  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0277  protein of unknown function DUF214  23.68 
 
 
431 aa  63.5  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  30.6 
 
 
397 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1696  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  23.2 
 
 
417 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1474  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  23.2 
 
 
417 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3117  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  23.2 
 
 
417 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2201  putative lipoprotein releasing system transmembrane protein  23.2 
 
 
417 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2718  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  23.2 
 
 
417 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  31.69 
 
 
427 aa  62.8  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1056  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.2 
 
 
416 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.504254 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  24.22 
 
 
423 aa  62  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2624  lipoprotein ABC transporter, permease protein LolE  25.3 
 
 
415 aa  62.4  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.857684  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.8 
 
 
418 aa  62.4  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0960  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.2 
 
 
416 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25 
 
 
423 aa  61.6  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1887  lipoprotein releasing system transmembrane protein, putative  23.2 
 
 
448 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.358126  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2360  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.8 
 
 
411 aa  61.6  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.069448  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  26.53 
 
 
397 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  23.48 
 
 
394 aa  61.2  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  26.16 
 
 
836 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.79 
 
 
416 aa  60.8  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25.91 
 
 
387 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  27.01 
 
 
371 aa  60.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1076  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.04 
 
 
416 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0609031  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.35 
 
 
423 aa  60.5  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  23.45 
 
 
393 aa  60.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  25.6 
 
 
397 aa  60.1  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1566  ABC lipoprotein efflux pump, inner membrane subunit  23.2 
 
 
417 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.764315  normal  0.414868 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.79 
 
 
417 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  31.16 
 
 
399 aa  59.7  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  28.71 
 
 
381 aa  60.1  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  27.08 
 
 
657 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  23.38 
 
 
414 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1336  hypothetical protein  22.58 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  22.29 
 
 
451 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  33.08 
 
 
443 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3181  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.6 
 
 
420 aa  59.3  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.488444  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.09 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2024  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.57 
 
 
417 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  28.24 
 
 
657 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  26.53 
 
 
397 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0489  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2567  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.8 
 
 
417 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178921  normal  0.0571791 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2132  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.22 
 
 
417 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.435353  normal  0.150883 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1156  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.22 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342008  normal  0.0203303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  28.35 
 
 
656 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  28.66 
 
 
849 aa  57.8  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.5 
 
 
420 aa  57.8  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2398  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.52 
 
 
418 aa  58.2  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.19 
 
 
408 aa  57.8  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  20.52 
 
 
408 aa  57.8  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2151  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.57 
 
 
417 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0738534  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  29.07 
 
 
505 aa  58.2  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.59 
 
 
641 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1563  protein of unknown function DUF214  24.36 
 
 
385 aa  57.4  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5420  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.22 
 
 
417 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5963  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.22 
 
 
417 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.28938  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  25.82 
 
 
405 aa  57.8  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2114  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.22 
 
 
417 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08589  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1117  lipoprotein releasing system transmembrane  22.4 
 
 
416 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0172186  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0613  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.2 
 
 
411 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000287642  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2080  transmembrane protein Vexp1  23.26 
 
 
425 aa  57  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0483  hypothetical protein  21.13 
 
 
373 aa  57  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.81 
 
 
414 aa  56.6  0.0000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  25.83 
 
 
397 aa  56.6  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.53 
 
 
415 aa  56.6  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>