65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0682 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0682  permease, putative  100 
 
 		 409 aa  825    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2419  hypothetical protein  29.72 
 
 		 478 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5456  hypothetical protein  29.02 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2558  ABC transporter, permease protein  29.37 
 
 		 474 aa  99.8  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308598 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2758  permease, putative  29.02 
 
 		 475 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  30.03 
 
 		 470 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1013  lipoprotein release ABC transporter permease  24.19 
 
 		 406 aa  93.6  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0613  transmembrane protein Vexp1  22.22 
 
 		 425 aa  92.4  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1143  efflux ABC transporter, permease protein  23.97 
 
 		 456 aa  90.5  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0615  transmembrane protein Vexp3  22.73 
 
 		 458 aa  87.8  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2080  transmembrane protein Vexp1  20.16 
 
 		 425 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2078  transmembrane protein Vexp3  21.54 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0226824  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1142  efflux ABC transporter, permease protein  25.14 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1014  lipoprotein release ABC transporter permease  23.08 
 
 		 398 aa  75.1  0.000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  24.41 
 
 		 464 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0438  peptide ABC transporter permease  23.3 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  22.08 
 
 		 505 aa  60.1  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  24.32 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  28.37 
 
 		 390 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0619  peptide ABC transporter permease  22.25 
 
 		 491 aa  57  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4227  hypothetical protein  24.55 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.405326  normal  0.650749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  24.57 
 
 		 388 aa  53.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  22.73 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  24.1 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  23.53 
 
 		 648 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  23.53 
 
 		 648 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  20.72 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  22.16 
 
 		 399 aa  50.1  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  27.17 
 
 		 401 aa  49.7  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  24.62 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  23.29 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  25.21 
 
 		 484 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  27.65 
 
 		 641 aa  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  23.35 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  27.06 
 
 		 641 aa  46.6  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  24.77 
 
 		 667 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  24.77 
 
 		 667 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  20.21 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  27.06 
 
 		 641 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  20.31 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  23.92 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  24.06 
 
 		 682 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  24.06 
 
 		 682 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  24.65 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  27.71 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  22.93 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  24.26 
 
 		 649 aa  44.3  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3400  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.089365  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1986  hypothetical protein  22.9 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  26.5 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  28.16 
 
 		 640 aa  43.9  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  24.02 
 
 		 378 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  21.51 
 
 		 376 aa  43.9  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  25.47 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  22.93 
 
 		 379 aa  43.9  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2967  hypothetical protein  23.34 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.68 
 
 		 394 aa  43.5  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 		 386 aa  43.9  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  21.51 
 
 		 393 aa  43.9  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  22.63 
 
 		 385 aa  43.5  0.007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  23.19 
 
 		 397 aa  43.5  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2805  hypothetical protein  22 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.275109  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0282  hypothetical protein  22 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.548142  hitchhiker  0.0000619818 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0301  hypothetical protein  22 
 
 		 388 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>