93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0438 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0438  peptide ABC transporter permease  100 
 
 
485 aa  936    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0619  peptide ABC transporter permease  54.91 
 
 
491 aa  408  1.0000000000000001e-112  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  39.69 
 
 
505 aa  280  6e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2558  ABC transporter, permease protein  29.74 
 
 
474 aa  176  8e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308598 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2758  permease, putative  29.88 
 
 
475 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2419  hypothetical protein  29.56 
 
 
478 aa  173  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5456  hypothetical protein  28.49 
 
 
475 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  27.7 
 
 
470 aa  170  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  24.84 
 
 
451 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0615  transmembrane protein Vexp3  25.77 
 
 
458 aa  98.2  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2078  transmembrane protein Vexp3  26.76 
 
 
458 aa  97.8  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0226824  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1013  lipoprotein release ABC transporter permease  24.02 
 
 
406 aa  95.5  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0613  transmembrane protein Vexp1  26.37 
 
 
425 aa  84.7  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1142  efflux ABC transporter, permease protein  24.62 
 
 
439 aa  84.3  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0682  permease, putative  24.29 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1623  hypothetical protein  24.16 
 
 
514 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.132347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2080  transmembrane protein Vexp1  26.56 
 
 
425 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  29.05 
 
 
484 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1143  efflux ABC transporter, permease protein  22.52 
 
 
456 aa  62.8  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 
484 aa  60.5  0.00000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1014  lipoprotein release ABC transporter permease  26.25 
 
 
398 aa  59.7  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1665  ABC transporter, permease protein, putative  26.83 
 
 
420 aa  58.9  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.644978 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28 
 
 
385 aa  57.8  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  23.18 
 
 
400 aa  56.2  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  25.46 
 
 
413 aa  56.2  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  23.24 
 
 
464 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2659  hypothetical protein  22.77 
 
 
421 aa  53.5  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  27.4 
 
 
397 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  26.94 
 
 
397 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  25.1 
 
 
414 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  28.07 
 
 
397 aa  52.4  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  27.85 
 
 
397 aa  52.8  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 
406 aa  51.2  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1335  ABC transporter, permease protein  26.45 
 
 
411 aa  50.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0113207  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 
429 aa  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5048  hypothetical protein  28.33 
 
 
399 aa  50.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2446  hypothetical protein  25.47 
 
 
479 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0214415  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5104  ABC transporter permease  28.19 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  29.19 
 
 
406 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5495  ABC transporter permease  28.19 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  27.6 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  24.34 
 
 
657 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  26.24 
 
 
421 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 
429 aa  47.8  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  30.05 
 
 
406 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  23.01 
 
 
416 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2448  hypothetical protein  24.9 
 
 
438 aa  47.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0464598  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0476  ABC transporter, permease protein  31 
 
 
399 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  23.08 
 
 
402 aa  47.4  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 
405 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  25.4 
 
 
405 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  25.53 
 
 
396 aa  47  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  25 
 
 
415 aa  47.4  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01532  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.33 
 
 
407 aa  47.4  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  25.62 
 
 
419 aa  47  0.0008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  27.4 
 
 
408 aa  47  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 
429 aa  46.2  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  40 
 
 
859 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  24.88 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  22.73 
 
 
849 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  24.34 
 
 
656 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  23.73 
 
 
391 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  23.73 
 
 
384 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  23.73 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  23.73 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  23.73 
 
 
383 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  23.73 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  23.73 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  23.16 
 
 
383 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0960  putative ABC transporter, permease protein  23.73 
 
 
383 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  22.96 
 
 
397 aa  44.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001465  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  25.09 
 
 
411 aa  44.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  19.65 
 
 
866 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  35.38 
 
 
414 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 
405 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  22.07 
 
 
849 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.21 
 
 
386 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 
405 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  26.75 
 
 
663 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003990  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  22.05 
 
 
414 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2205  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.66 
 
 
414 aa  43.9  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  20.7 
 
 
842 aa  43.9  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1558  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.29 
 
 
468 aa  43.9  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.457306  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  23.16 
 
 
391 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1613  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 
779 aa  43.5  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.0478935 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1498  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.66 
 
 
414 aa  43.5  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00176563  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2008  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.66 
 
 
414 aa  43.5  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0630458 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2483  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.66 
 
 
412 aa  43.5  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00147297  normal  0.0550252 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2529  lipoprotein releasing system, transmembrane protein LolE  23.66 
 
 
412 aa  43.5  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138294  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1240  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.66 
 
 
414 aa  43.5  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00286068  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1240  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolE  23.66 
 
 
414 aa  43.5  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0067716  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2198  ABC transporter, permease protein  34.12 
 
 
421 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000781138 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  25.87 
 
 
395 aa  43.1  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>