More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2448 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2448  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  822    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0464598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2446  hypothetical protein  48.16 
 
 		 479 aa  325  8.000000000000001e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0214415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5451  protein of unknown function DUF214  35.7 
 
 		 511 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289306  normal  0.390939 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1311  protein of unknown function DUF214  38.96 
 
 		 468 aa  219  1e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.141465  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  27.34 
 
 		 411 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.4 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0856  ABC transporter, permease protein, putative  25.85 
 
 		 407 aa  70.5  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0945492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  22.33 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  24.62 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  23.48 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.14 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  26.59 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  33.16 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.28 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  26.35 
 
 		 404 aa  66.6  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  25.15 
 
 		 464 aa  64.7  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  26.01 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  25.1 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  24.81 
 
 		 405 aa  63.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  25.66 
 
 		 443 aa  63.5  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  24.2 
 
 		 414 aa  63.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3659  protein of unknown function DUF214  29.19 
 
 		 462 aa  62.8  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.410687  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  24.04 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  24.53 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  26.46 
 
 		 407 aa  62  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  28.26 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  20.68 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  27.52 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  23.57 
 
 		 386 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  24.25 
 
 		 406 aa  60.5  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0774  hypothetical protein  25.23 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.98334  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  34.75 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 398 aa  60.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  23.53 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  28.84 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.57 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_002950  PG0281  ABC transporter, permease protein, putative  23.66 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  23.67 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  27.39 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  26.7 
 
 		 386 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  26.91 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  21.82 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.78 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.25 
 
 		 852 aa  58.9  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  24.48 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1528  hypothetical protein  26.52 
 
 		 409 aa  58.2  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.275544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  24.17 
 
 		 385 aa  57.4  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  27.44 
 
 		 405 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.64 
 
 		 419 aa  57  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 		 408 aa  57  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1359  permease, putative  23.75 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00178118  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  29.03 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  31.06 
 
 		 395 aa  55.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 		 405 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  28.52 
 
 		 416 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  23.38 
 
 		 792 aa  55.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  28.87 
 
 		 855 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  25.74 
 
 		 408 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  28.38 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  28.85 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  22.73 
 
 		 386 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  28.81 
 
 		 896 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 		 400 aa  55.8  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.51 
 
 		 385 aa  54.7  0.000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  24.37 
 
 		 404 aa  55.1  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  26.37 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.12 
 
 		 649 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  22.65 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  24.81 
 
 		 402 aa  53.9  0.000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  27.34 
 
 		 410 aa  53.5  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  24.86 
 
 		 397 aa  53.5  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  26.12 
 
 		 416 aa  53.5  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.77 
 
 		 649 aa  53.1  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  20.55 
 
 		 395 aa  53.1  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  31.07 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  29.91 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  28.5 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  33.53 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.8 
 
 		 443 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  24.1 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  30.43 
 
 		 413 aa  53.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  31.14 
 
 		 849 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  23.43 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  29.01 
 
 		 653 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  23.77 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  27.78 
 
 		 837 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  22.06 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  23.79 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  30.51 
 
 		 843 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2281  ABC transporter, permease protein, putative  26.7 
 
 		 419 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0835073 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  26.5 
 
 		 408 aa  52  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  33.91 
 
 		 845 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  24.57 
 
 		 400 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  25.26 
 
 		 418 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0223  hypothetical protein  29.92 
 
 		 401 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  26.26 
 
 		 657 aa  51.2  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>