More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0281 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0281  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 458 aa  945    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5612  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 		 414 aa  170  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2349  protein of unknown function DUF214  27.35 
 
 		 415 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.36 
 
 		 805 aa  93.2  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  21.83 
 
 		 784 aa  87.8  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  25.68 
 
 		 845 aa  87  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.14 
 
 		 805 aa  84.3  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  26.37 
 
 		 801 aa  83.6  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  26.4 
 
 		 789 aa  83.2  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  24.15 
 
 		 802 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  24.2 
 
 		 869 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.24 
 
 		 816 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  26.26 
 
 		 397 aa  82  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  29.37 
 
 		 395 aa  82.4  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3363  hypothetical protein  22.25 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  26.48 
 
 		 811 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.87 
 
 		 648 aa  78.2  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  24.51 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  24.14 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  23.01 
 
 		 808 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  24.64 
 
 		 411 aa  76.3  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  22.22 
 
 		 443 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  23.74 
 
 		 420 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  27.48 
 
 		 805 aa  75.1  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  22.91 
 
 		 805 aa  74.3  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  25.08 
 
 		 411 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.93 
 
 		 822 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  24.75 
 
 		 642 aa  74.3  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  23.86 
 
 		 668 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  23.75 
 
 		 795 aa  73.6  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  22.15 
 
 		 410 aa  73.6  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 		 791 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  23.1 
 
 		 651 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3502  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 		 432 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592439  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  23.62 
 
 		 682 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  23.62 
 
 		 667 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  22.04 
 
 		 793 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  23.62 
 
 		 667 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  23.62 
 
 		 682 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 		 420 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  22.63 
 
 		 788 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.66 
 
 		 807 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.46 
 
 		 817 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0899  hypothetical protein  21.79 
 
 		 437 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.811824  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  25.27 
 
 		 797 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 		 789 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0724  hypothetical protein  23.36 
 
 		 436 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  22.68 
 
 		 805 aa  71.2  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25 
 
 		 807 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  26.33 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  25.64 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  28.46 
 
 		 819 aa  71.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  25.23 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  24.58 
 
 		 642 aa  70.5  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  22.75 
 
 		 793 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  22.98 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  23.87 
 
 		 770 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.49 
 
 		 649 aa  69.7  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  23.52 
 
 		 811 aa  70.1  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 		 420 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  24.23 
 
 		 647 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  22.88 
 
 		 421 aa  69.3  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.8 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4121  protein of unknown function DUF214  23.62 
 
 		 789 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0606813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  23.57 
 
 		 657 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  23.86 
 
 		 687 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  21.77 
 
 		 403 aa  69.3  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.19 
 
 		 649 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  24.68 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  23.78 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  23.84 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  23.86 
 
 		 681 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  23.86 
 
 		 681 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  22.39 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  22.39 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.39 
 
 		 648 aa  68.6  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  22.19 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  22.7 
 
 		 696 aa  68.6  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  24.9 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  21.88 
 
 		 788 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.39 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  24.86 
 
 		 407 aa  68.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  25.24 
 
 		 803 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  22.39 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.39 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  24.9 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.39 
 
 		 648 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  23.28 
 
 		 653 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.37 
 
 		 823 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  23.93 
 
 		 809 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  23.28 
 
 		 653 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  23.28 
 
 		 653 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  22.19 
 
 		 653 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  24.72 
 
 		 809 aa  67.4  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  22.44 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  22.39 
 
 		 648 aa  67.4  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.01 
 
 		 656 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.73 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2953  protein of unknown function DUF214  20.9 
 
 		 406 aa  67  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>