More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5612 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5612  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 414 aa  845    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2349  protein of unknown function DUF214  61.45 
 
 		 415 aa  511  1e-144  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0281  ABC transporter, permease protein, putative  29.95 
 
 		 458 aa  184  2.0000000000000003e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 792 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  26.93 
 
 		 795 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 789 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 791 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  22.64 
 
 		 793 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  26.97 
 
 		 808 aa  100  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  23.74 
 
 		 791 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  24.14 
 
 		 810 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  25.13 
 
 		 797 aa  99.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  26.12 
 
 		 807 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 		 770 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  24.66 
 
 		 406 aa  95.9  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  24.66 
 
 		 798 aa  95.5  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.46 
 
 		 805 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 793 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 		 788 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  20.98 
 
 		 805 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  25.19 
 
 		 793 aa  94.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  22.63 
 
 		 792 aa  92.4  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  25 
 
 		 651 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.05 
 
 		 808 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3363  hypothetical protein  19.27 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 		 795 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  24.61 
 
 		 785 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 		 777 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  21.62 
 
 		 406 aa  90.5  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  21.53 
 
 		 411 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  25.23 
 
 		 663 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  24.02 
 
 		 804 aa  90.1  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2084  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 		 801 aa  89.7  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.326443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  24.88 
 
 		 663 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  23.13 
 
 		 821 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  23.49 
 
 		 406 aa  88.6  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  23.4 
 
 		 784 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2863  hypothetical protein  20.95 
 
 		 435 aa  87.8  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  23.01 
 
 		 423 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  21.81 
 
 		 818 aa  87  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  22.74 
 
 		 657 aa  87  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4071  hypothetical protein  22.17 
 
 		 433 aa  87  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 		 804 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  25.39 
 
 		 443 aa  86.7  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  23.36 
 
 		 401 aa  86.7  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4861  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 798 aa  86.3  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.218839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2853  protein of unknown function DUF214  22.17 
 
 		 792 aa  86.3  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317184  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  23.26 
 
 		 648 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  23.26 
 
 		 648 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.26 
 
 		 648 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  23.26 
 
 		 648 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  25.75 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.26 
 
 		 648 aa  86.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.26 
 
 		 648 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  21.55 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.26 
 
 		 648 aa  85.9  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00510496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  23.62 
 
 		 789 aa  84.7  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 813 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  25.76 
 
 		 696 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  23.83 
 
 		 667 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.94 
 
 		 648 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.51 
 
 		 656 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  20.96 
 
 		 397 aa  84.7  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 804 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.02 
 
 		 648 aa  84.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  23 
 
 		 800 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0959  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 		 780 aa  84  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000592859  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  24.1 
 
 		 802 aa  84.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  26.55 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  27.67 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  23.13 
 
 		 798 aa  84  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 		 407 aa  84  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  23.6 
 
 		 667 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  22.69 
 
 		 642 aa  83.6  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  23.2 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 		 797 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  26.67 
 
 		 647 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  24.09 
 
 		 657 aa  83.2  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4641  protein of unknown function DUF214  21.56 
 
 		 836 aa  83.2  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0388606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  23.2 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  26.3 
 
 		 805 aa  82.8  0.000000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 		 418 aa  82.8  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  23.73 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  26.62 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 		 806 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  23.83 
 
 		 656 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  23.36 
 
 		 682 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  22.97 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3764  protein of unknown function DUF214  22.43 
 
 		 714 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  23.97 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.64 
 
 		 648 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.64 
 
 		 648 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.4 
 
 		 648 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  23.36 
 
 		 682 aa  82  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  23.41 
 
 		 420 aa  81.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.35 
 
 		 648 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.6 
 
 		 822 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.67 
 
 		 419 aa  81.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>