More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2863 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2863  hypothetical protein  100 
 
 		 435 aa  900    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0724  hypothetical protein  60.32 
 
 		 436 aa  553  1e-156  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0999  hypothetical protein  62.84 
 
 		 436 aa  545  1e-154  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2990  hypothetical protein  62.84 
 
 		 436 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1020  protein of unknown function DUF214  62.61 
 
 		 436 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3340  hypothetical protein  62.61 
 
 		 436 aa  547  1e-154  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1032  hypothetical protein  62.84 
 
 		 436 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2849  hypothetical protein  62.16 
 
 		 436 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0899  hypothetical protein  59.95 
 
 		 437 aa  534  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.811824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4071  hypothetical protein  58.39 
 
 		 433 aa  532  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3363  hypothetical protein  57.47 
 
 		 433 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3721  hypothetical protein  61.15 
 
 		 433 aa  514  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.232567  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3259  hypothetical protein  55.96 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0864  hypothetical protein  55.5 
 
 		 434 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3158  hypothetical protein  55.73 
 
 		 434 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2407  hypothetical protein  37.67 
 
 		 438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3502  protein of unknown function DUF214  39.23 
 
 		 432 aa  256  5e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592439  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2240  hypothetical protein  33.71 
 
 		 435 aa  256  6e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0574  putative ABC transporter, permease protein  29.8 
 
 		 432 aa  159  8e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3929  protein of unknown function DUF214  25.12 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5612  protein of unknown function DUF214  21.65 
 
 		 414 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.45 
 
 		 805 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.09 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  24.95 
 
 		 797 aa  85.9  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  20.98 
 
 		 793 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  22.91 
 
 		 406 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  23.23 
 
 		 810 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  22.05 
 
 		 795 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  24.57 
 
 		 798 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  21.62 
 
 		 800 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  23.39 
 
 		 797 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  21.67 
 
 		 391 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  22.7 
 
 		 808 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  22.73 
 
 		 813 aa  78.2  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  22.83 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  20.73 
 
 		 805 aa  77.4  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.72 
 
 		 808 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  22.25 
 
 		 808 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.94 
 
 		 812 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  21.9 
 
 		 801 aa  75.1  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  24.94 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  23.21 
 
 		 805 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  22.51 
 
 		 807 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  20.13 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.46 
 
 		 882 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.65 
 
 		 805 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 816 aa  73.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2349  protein of unknown function DUF214  20.05 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  21.49 
 
 		 798 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  24.88 
 
 		 821 aa  73.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  21.22 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  22.4 
 
 		 392 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.02 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  23.33 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0281  ABC transporter, permease protein, putative  21.48 
 
 		 458 aa  70.9  0.00000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4899  protein of unknown function DUF214  21.85 
 
 		 802 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000216897  normal  0.089059 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  22.33 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4377  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.83 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  22.98 
 
 		 800 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  23.96 
 
 		 405 aa  70.5  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.62 
 
 		 817 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  20.94 
 
 		 795 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.74 
 
 		 844 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  26.96 
 
 		 399 aa  70.1  0.00000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  23.22 
 
 		 411 aa  69.7  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  33.07 
 
 		 849 aa  69.3  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  21.59 
 
 		 808 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  22.25 
 
 		 401 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  22.6 
 
 		 811 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  23.58 
 
 		 809 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  21.87 
 
 		 656 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  21.49 
 
 		 806 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  22.52 
 
 		 657 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.94 
 
 		 437 aa  68.9  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  21.27 
 
 		 785 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  22.29 
 
 		 642 aa  68.6  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  22.13 
 
 		 671 aa  68.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  21.04 
 
 		 804 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  22.39 
 
 		 788 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.37 
 
 		 805 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  20.39 
 
 		 793 aa  67.8  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  24.33 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  23.81 
 
 		 661 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  22.65 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 		 411 aa  67.8  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  21.01 
 
 		 804 aa  67.4  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4610  protein of unknown function DUF214  22.54 
 
 		 798 aa  67.4  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22275 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  22.22 
 
 		 663 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  21.5 
 
 		 715 aa  67.4  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27890  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  23.03 
 
 		 495 aa  67  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.140819  normal  0.653977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4598  protein of unknown function DUF214  23.23 
 
 		 784 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  22.17 
 
 		 642 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  21.57 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 		 770 aa  66.6  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  22.22 
 
 		 657 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  20.44 
 
 		 394 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>