More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2990 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1032  hypothetical protein  96.56 
 
 		 436 aa  824    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2990  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  892    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1020  protein of unknown function DUF214  97.25 
 
 		 436 aa  824    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0999  hypothetical protein  95.64 
 
 		 436 aa  816    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3340  hypothetical protein  97.02 
 
 		 436 aa  824    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0724  hypothetical protein  76.38 
 
 		 436 aa  686    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2849  hypothetical protein  71.56 
 
 		 436 aa  615  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0899  hypothetical protein  68.88 
 
 		 437 aa  614  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.811824  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4071  hypothetical protein  66.06 
 
 		 433 aa  611  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3363  hypothetical protein  64.68 
 
 		 433 aa  570  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3721  hypothetical protein  66.51 
 
 		 433 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.232567  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2863  hypothetical protein  62.84 
 
 		 435 aa  557  1e-157  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0864  hypothetical protein  63.39 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3158  hypothetical protein  63.39 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3259  hypothetical protein  63.39 
 
 		 434 aa  536  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2407  hypothetical protein  39.59 
 
 		 438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2240  hypothetical protein  36.57 
 
 		 435 aa  278  1e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3502  protein of unknown function DUF214  39.55 
 
 		 432 aa  272  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592439  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0574  putative ABC transporter, permease protein  33.18 
 
 		 432 aa  201  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3929  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  24.39 
 
 		 402 aa  91.7  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  23.94 
 
 		 802 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  23.3 
 
 		 785 aa  88.2  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.89 
 
 		 805 aa  88.2  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 		 810 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  24.78 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  21.98 
 
 		 793 aa  80.9  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  23.31 
 
 		 797 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  22.45 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.02 
 
 		 412 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  24.61 
 
 		 770 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  21.52 
 
 		 805 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4121  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 		 789 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0606813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5612  protein of unknown function DUF214  22.2 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  25.54 
 
 		 801 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  22.53 
 
 		 798 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.11 
 
 		 808 aa  78.6  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 		 795 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 		 808 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  23.09 
 
 		 801 aa  77.8  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  23.62 
 
 		 647 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  24.27 
 
 		 805 aa  77  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  22.86 
 
 		 807 aa  76.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  25 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  23.06 
 
 		 805 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4641  protein of unknown function DUF214  23.23 
 
 		 836 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0388606  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0281  ABC transporter, permease protein, putative  21.48 
 
 		 458 aa  75.5  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4618  protein of unknown function DUF214  21.17 
 
 		 808 aa  75.5  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.154299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.68 
 
 		 844 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0959  protein of unknown function DUF214  23.2 
 
 		 780 aa  75.1  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000592859  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.56 
 
 		 805 aa  74.7  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  25.08 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.53 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  23.71 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 		 409 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  24.78 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  22.47 
 
 		 795 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3764  protein of unknown function DUF214  24.67 
 
 		 714 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  23.2 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  23.4 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  23.11 
 
 		 804 aa  73.2  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  24.67 
 
 		 798 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  23.08 
 
 		 452 aa  73.2  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  23.55 
 
 		 800 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.43 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  22.79 
 
 		 791 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  34.19 
 
 		 784 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  23.67 
 
 		 804 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  21.5 
 
 		 401 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  23.59 
 
 		 410 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0683  ABC transporter, permease protein, putative  24.18 
 
 		 788 aa  71.2  0.00000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0106782 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  23.26 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0472  hypothetical protein  24.21 
 
 		 807 aa  71.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.68 
 
 		 656 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  23.44 
 
 		 789 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 		 412 aa  70.5  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  24.37 
 
 		 656 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.36 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  22.54 
 
 		 793 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  22.19 
 
 		 657 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  21.97 
 
 		 663 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  21.58 
 
 		 648 aa  70.1  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  22.49 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 		 797 aa  69.7  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  23.05 
 
 		 663 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  26.82 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  21.13 
 
 		 791 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  22.91 
 
 		 654 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  22.36 
 
 		 813 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  27.12 
 
 		 800 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  20.92 
 
 		 803 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  23.08 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  22.84 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  22.61 
 
 		 667 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  22.61 
 
 		 667 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  34.38 
 
 		 802 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  22.57 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  21.68 
 
 		 792 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.79 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>