More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2407 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2407  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  900    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2240  hypothetical protein  48.85 
 
 		 435 aa  444  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3502  protein of unknown function DUF214  46.92 
 
 		 432 aa  357  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.592439  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3363  hypothetical protein  40.32 
 
 		 433 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4071  hypothetical protein  39.86 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0724  hypothetical protein  39.6 
 
 		 436 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0899  hypothetical protein  38.17 
 
 		 437 aa  306  7e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.811824  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3721  hypothetical protein  40 
 
 		 433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.232567  normal  0.254233 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2863  hypothetical protein  37.67 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3158  hypothetical protein  40.45 
 
 		 434 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3259  hypothetical protein  40.23 
 
 		 434 aa  300  4e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0864  hypothetical protein  40.23 
 
 		 434 aa  298  1e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2990  hypothetical protein  39.59 
 
 		 436 aa  291  1e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2849  hypothetical protein  40.41 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3340  hypothetical protein  39.59 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1020  protein of unknown function DUF214  39.59 
 
 		 436 aa  287  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1032  hypothetical protein  39.14 
 
 		 436 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0999  hypothetical protein  39.14 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0574  putative ABC transporter, permease protein  30.93 
 
 		 432 aa  211  3e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3929  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 		 432 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.5 
 
 		 437 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0281  ABC transporter, permease protein, putative  21.85 
 
 		 458 aa  80.9  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  24.29 
 
 		 406 aa  80.5  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  22.39 
 
 		 811 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.74 
 
 		 805 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.13 
 
 		 412 aa  77.8  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.64 
 
 		 805 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  23.32 
 
 		 715 aa  75.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  24.83 
 
 		 808 aa  76.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  22.1 
 
 		 400 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  22 
 
 		 402 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  24.32 
 
 		 821 aa  75.1  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  23.67 
 
 		 805 aa  74.3  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  23.32 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5053  hypothetical protein  22.08 
 
 		 414 aa  73.2  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.662722  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  24.01 
 
 		 802 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  24.78 
 
 		 810 aa  72.8  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  22.78 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  22.42 
 
 		 805 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  22.32 
 
 		 807 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  22.88 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  20.83 
 
 		 793 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  20.57 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  25.49 
 
 		 649 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  24.46 
 
 		 647 aa  69.3  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 		 804 aa  69.3  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 		 401 aa  69.7  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.5 
 
 		 813 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  21.52 
 
 		 805 aa  69.3  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  23.68 
 
 		 804 aa  68.6  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  21.15 
 
 		 797 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  23.14 
 
 		 800 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  22.89 
 
 		 400 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  19.27 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  21.91 
 
 		 797 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.53 
 
 		 844 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4414  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.82 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  21.29 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  29.51 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  21.56 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  19.14 
 
 		 413 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  22.55 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  22.49 
 
 		 789 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  24.29 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  19.63 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  19.63 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5612  protein of unknown function DUF214  22.22 
 
 		 414 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  22 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  22.83 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  21.24 
 
 		 808 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 		 797 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  21.25 
 
 		 400 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  22.68 
 
 		 414 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  20.81 
 
 		 395 aa  66.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  20.27 
 
 		 696 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  21.94 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  23.33 
 
 		 800 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.71 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  21.43 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0184  hypothetical protein  20.52 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.430576  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  20.4 
 
 		 421 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  19.27 
 
 		 793 aa  64.7  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  23.88 
 
 		 798 aa  64.7  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  22.77 
 
 		 657 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  26.43 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0189  hypothetical protein  20.52 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  23.06 
 
 		 809 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  21.05 
 
 		 791 aa  64.3  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.95 
 
 		 823 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  21.62 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  22.8 
 
 		 869 aa  64.3  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  22.27 
 
 		 784 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  21.01 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.13 
 
 		 817 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  22.49 
 
 		 806 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  22.31 
 
 		 795 aa  63.5  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>