More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2349 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2349  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 415 aa  843    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5612  protein of unknown function DUF214  61.45 
 
 		 414 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0281  ABC transporter, permease protein, putative  27.35 
 
 		 458 aa  160  4e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  30.77 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  26.5 
 
 		 792 aa  109  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 		 793 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3774  protein of unknown function DUF214  25.59 
 
 		 791 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 		 423 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  30.1 
 
 		 421 aa  103  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  28.17 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 421 aa  100  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  25.36 
 
 		 770 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4840  protein of unknown function DUF214  22.1 
 
 		 810 aa  99  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.259968 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4859  protein of unknown function DUF214  23.57 
 
 		 792 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0508357 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  27.48 
 
 		 421 aa  98.6  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  25.94 
 
 		 807 aa  97.8  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1760  protein of unknown function DUF214  21.91 
 
 		 798 aa  97.1  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.962231  normal  0.806233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  25.57 
 
 		 795 aa  96.7  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  22.43 
 
 		 805 aa  95.5  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 		 797 aa  94.4  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  25.52 
 
 		 785 aa  94  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  26.57 
 
 		 413 aa  93.2  9e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  23.57 
 
 		 667 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  24.31 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3610  protein of unknown function DUF214  25.53 
 
 		 789 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.251487  hitchhiker  0.000460877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.81 
 
 		 822 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  24.43 
 
 		 804 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  28.32 
 
 		 791 aa  91.7  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  23.33 
 
 		 682 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  23.33 
 
 		 682 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 		 793 aa  90.5  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2853  protein of unknown function DUF214  24.42 
 
 		 792 aa  90.1  6e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  26.3 
 
 		 806 aa  90.1  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  23.53 
 
 		 402 aa  89.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4642  protein of unknown function DUF214  22.87 
 
 		 801 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000162597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.27 
 
 		 805 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3764  protein of unknown function DUF214  22.33 
 
 		 714 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2464  protein of unknown function DUF214  25.87 
 
 		 792 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0427191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  23.18 
 
 		 805 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  24.07 
 
 		 793 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  24.8 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  22.93 
 
 		 667 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  26.58 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  26.58 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  24.77 
 
 		 791 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.86 
 
 		 656 aa  86.3  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 		 795 aa  86.7  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4607  protein of unknown function DUF214  24.55 
 
 		 811 aa  86.7  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.727239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  25.84 
 
 		 797 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1651  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 		 800 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.9714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  25.83 
 
 		 656 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  24.86 
 
 		 800 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3433  protein of unknown function DUF214  23.2 
 
 		 809 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.560491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  23.08 
 
 		 821 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  23.11 
 
 		 406 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0946  protein of unknown function DUF214  24.24 
 
 		 811 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0636154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  23.06 
 
 		 657 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  27.58 
 
 		 398 aa  84.3  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  20.57 
 
 		 804 aa  84.3  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4641  protein of unknown function DUF214  23.27 
 
 		 836 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0388606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  21.96 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  24.67 
 
 		 811 aa  84  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  22.38 
 
 		 656 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  26.97 
 
 		 410 aa  84  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  24.01 
 
 		 663 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  24.66 
 
 		 788 aa  83.6  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  23.56 
 
 		 808 aa  83.2  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  21.96 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  24.83 
 
 		 802 aa  83.2  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  28 
 
 		 404 aa  83.2  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  23.23 
 
 		 798 aa  83.2  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  26.97 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  25.11 
 
 		 784 aa  83.2  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3363  hypothetical protein  20.67 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  22.2 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  21.5 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  29.67 
 
 		 417 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0943  protein of unknown function DUF214  24.66 
 
 		 802 aa  82  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.747295 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  25.99 
 
 		 414 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5545  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 788 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.366096  normal  0.609704 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 		 406 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 		 811 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  24.59 
 
 		 795 aa  81.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  23.78 
 
 		 663 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  25.5 
 
 		 409 aa  80.9  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.06 
 
 		 648 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  23.64 
 
 		 648 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  23.64 
 
 		 648 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.25 
 
 		 808 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  25.51 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1539  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 		 804 aa  80.5  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  24.7 
 
 		 808 aa  80.5  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  26.84 
 
 		 409 aa  80.1  0.00000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  24.94 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  24.67 
 
 		 403 aa  80.1  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4121  protein of unknown function DUF214  22.33 
 
 		 789 aa  80.1  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0606813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  24.02 
 
 		 794 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  21.9 
 
 		 653 aa  79.7  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  21.58 
 
 		 402 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>