More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1311 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1311  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 468 aa  883    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.141465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5451  protein of unknown function DUF214  43.8 
 
 		 511 aa  293  5e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.289306  normal  0.390939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2446  hypothetical protein  42.16 
 
 		 479 aa  268  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0214415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2448  hypothetical protein  39.29 
 
 		 438 aa  247  4e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0464598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  27.73 
 
 		 414 aa  82.4  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  22.92 
 
 		 414 aa  82  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  29.89 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  23.17 
 
 		 405 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.11 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  25.49 
 
 		 389 aa  71.2  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.91 
 
 		 386 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  23.86 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1376  hypothetical protein  32.24 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  30.57 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  37.5 
 
 		 395 aa  67  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  25.52 
 
 		 443 aa  67  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  32.75 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  23.26 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  27.27 
 
 		 386 aa  65.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  29.69 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  25.53 
 
 		 412 aa  64.3  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  28.49 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  28.34 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  25.15 
 
 		 406 aa  62.8  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  30.21 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  29.29 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_002936  DET0856  ABC transporter, permease protein, putative  26.37 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0945492  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  28.86 
 
 		 404 aa  62  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  29.69 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 		 410 aa  62  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  23.29 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  21.84 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3519  protein of unknown function DUF214  24.02 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225235  normal  0.132299 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  29.69 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26 
 
 		 871 aa  60.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  25.96 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  27.35 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  23.61 
 
 		 391 aa  60.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  25.13 
 
 		 857 aa  60.1  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  25.61 
 
 		 404 aa  60.1  0.00000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  24.51 
 
 		 715 aa  60.1  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  31.71 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  23.81 
 
 		 386 aa  59.7  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0774  hypothetical protein  26.32 
 
 		 407 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.98334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  20.83 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  29.63 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  27.25 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.57 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1983  protein of unknown function DUF214  26.05 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  23.68 
 
 		 386 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  23.51 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  24.5 
 
 		 401 aa  58.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  27.6 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  26.27 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  26.99 
 
 		 658 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  27.09 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 		 418 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  25.91 
 
 		 644 aa  58.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  27.19 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  26.23 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  24.88 
 
 		 657 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  24.34 
 
 		 397 aa  57  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  25.11 
 
 		 406 aa  57  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  26.21 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  23.95 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.81 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  25.11 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  23.09 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0699  hypothetical protein  23.79 
 
 		 404 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0151116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  29.45 
 
 		 863 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  23.68 
 
 		 403 aa  56.2  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  25.36 
 
 		 656 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3196  hypothetical protein  25.21 
 
 		 410 aa  55.5  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  23 
 
 		 413 aa  55.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3269  hypothetical protein  26.43 
 
 		 417 aa  55.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392624  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  26.09 
 
 		 661 aa  55.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.94 
 
 		 413 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  28.86 
 
 		 464 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  26.21 
 
 		 376 aa  55.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  28.06 
 
 		 383 aa  55.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  28.24 
 
 		 656 aa  55.1  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  21.36 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1528  hypothetical protein  28.57 
 
 		 409 aa  55.1  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.275544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  26.55 
 
 		 406 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0187  hypothetical protein  28.99 
 
 		 364 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427109 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  27.92 
 
 		 653 aa  55.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  27.27 
 
 		 657 aa  55.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  24.06 
 
 		 386 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  21.3 
 
 		 415 aa  54.7  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1761  hypothetical protein  23.33 
 
 		 402 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000119528  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  20.82 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  24.15 
 
 		 412 aa  54.3  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  27.48 
 
 		 410 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 		 387 aa  54.3  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  28.42 
 
 		 400 aa  53.9  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  26.11 
 
 		 406 aa  54.3  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  24.57 
 
 		 395 aa  54.3  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2050  peptide ABC transporter permease  26.23 
 
 		 393 aa  54.3  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>