More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1101 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  100 
 
 		 484 aa  917    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  80.7 
 
 		 484 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  38.2 
 
 		 464 aa  238  3e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  27.79 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  30.6 
 
 		 397 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.71 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  30.05 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  31.15 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.42 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.52 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  35.42 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  28.57 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  30.6 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1535  protein of unknown function DUF214  35.45 
 
 		 417 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  25.35 
 
 		 390 aa  72  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  27.93 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  30 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  28.85 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1337  ABC transporter efflux protein  31.98 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0119  hypothetical protein  29.67 
 
 		 397 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.395515 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  27.9 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2039  lipoprotein releasing system, permease protein, putative  27.21 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  27.18 
 
 		 397 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  31.15 
 
 		 371 aa  68.2  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  25.65 
 
 		 387 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  26.67 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  28.84 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  25.81 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0619  peptide ABC transporter permease  28.02 
 
 		 491 aa  67.8  0.0000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  26.87 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  25.37 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  29.12 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  28.76 
 
 		 404 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.15 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  27.62 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5456  hypothetical protein  24.92 
 
 		 475 aa  64.3  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  31.16 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  36.21 
 
 		 411 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  27.73 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0081  hypothetical protein  27.44 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.466459  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  22.26 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 		 405 aa  63.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  37.28 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.47 
 
 		 641 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2758  permease, putative  25.55 
 
 		 475 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213868  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  27.65 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  27.65 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2558  ABC transporter, permease protein  25.23 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308598 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000978  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component  28.69 
 
 		 422 aa  62.4  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  27.11 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3344  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.33 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  23.96 
 
 		 387 aa  61.6  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  27.11 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  32.16 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  24.66 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  23.68 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.48 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  21.94 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  27.04 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  30.1 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  29.71 
 
 		 394 aa  60.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2419  hypothetical protein  25.55 
 
 		 478 aa  60.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  26.16 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.36 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  27.88 
 
 		 403 aa  60.5  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2404  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.34 
 
 		 438 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.311939  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.48 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  29.52 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  25.45 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  28.27 
 
 		 670 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.78 
 
 		 416 aa  60.1  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  25.66 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  27.73 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.29 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  27.23 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  21 
 
 		 451 aa  59.3  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1142  efflux ABC transporter, permease protein  30.7 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.47 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  26.16 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2428  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.85 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507047  normal  0.0670699 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07028  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  28.69 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  23.24 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  26.18 
 
 		 397 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4409  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.28 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0277  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.05 
 
 		 408 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  28.93 
 
 		 418 aa  58.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  25.41 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  25.4 
 
 		 389 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  24.39 
 
 		 402 aa  57.8  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  25.41 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  27.56 
 
 		 405 aa  57.8  0.0000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  24.77 
 
 		 641 aa  57.8  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  26.27 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  25.71 
 
 		 402 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  25.72 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3757  hypothetical protein  29.52 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000165799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3236  hypothetical protein  29.63 
 
 		 650 aa  57.4  0.0000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>