49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0940 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  100 
 
 		 505 aa  992    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0619  peptide ABC transporter permease  43.5 
 
 		 491 aa  273  5.000000000000001e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0438  peptide ABC transporter permease  38.03 
 
 		 485 aa  267  4e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5456  hypothetical protein  26.9 
 
 		 475 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2558  ABC transporter, permease protein  27.54 
 
 		 474 aa  163  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308598 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  26.2 
 
 		 470 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2758  permease, putative  27.63 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213868  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2419  hypothetical protein  26.6 
 
 		 478 aa  154  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1623  hypothetical protein  26.28 
 
 		 514 aa  100  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.132347  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1014  lipoprotein release ABC transporter permease  27.51 
 
 		 398 aa  99.4  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  22.11 
 
 		 451 aa  97.4  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0615  transmembrane protein Vexp3  25.64 
 
 		 458 aa  95.5  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0613  transmembrane protein Vexp1  23.82 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1013  lipoprotein release ABC transporter permease  26.97 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2078  transmembrane protein Vexp3  27.02 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0226824  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  35.2 
 
 		 484 aa  73.6  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1142  efflux ABC transporter, permease protein  24.17 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1143  efflux ABC transporter, permease protein  27.12 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2080  transmembrane protein Vexp1  22.83 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1177  protein of unknown function DUF214  29.7 
 
 		 484 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000214205 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  25.07 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0682  permease, putative  22.08 
 
 		 409 aa  63.2  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  27.27 
 
 		 408 aa  59.7  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  25.23 
 
 		 413 aa  55.5  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1146  hypothetical protein  21.46 
 
 		 787 aa  54.3  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2259  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC, putative  22.54 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2154  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.94 
 
 		 416 aa  52.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.97636  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1376  hypothetical protein  28.11 
 
 		 386 aa  52  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2581  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 379 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  24.89 
 
 		 866 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2285  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.23 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0114014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1734  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.48 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00172788  normal  0.754695 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1814  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.48 
 
 		 416 aa  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.109352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  22.8 
 
 		 853 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2391  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.22 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000572807  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2507  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.22 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.548469  normal  0.0346444 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.53 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  26.97 
 
 		 648 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1956  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.86 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00381099  normal  0.0209903 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1547  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.2 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.124688  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  23.42 
 
 		 400 aa  45.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2402  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.86 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0366774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2829  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.5 
 
 		 419 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.417689  normal  0.0183937 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  26.85 
 
 		 650 aa  44.3  0.006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  24.19 
 
 		 406 aa  43.9  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3974  protein of unknown function DUF214  25.7 
 
 		 952 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.146468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1335  ABC transporter, permease protein  27.97 
 
 		 411 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0113207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0857  protein of unknown function DUF214  23.05 
 
 		 459 aa  43.5  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>