30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1014 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1014  lipoprotein release ABC transporter permease  100 
 
 
398 aa  811    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1143  efflux ABC transporter, permease protein  54.57 
 
 
456 aa  432  1e-120  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0615  transmembrane protein Vexp3  34.1 
 
 
458 aa  248  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2078  transmembrane protein Vexp3  31.73 
 
 
458 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0226824  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2080  transmembrane protein Vexp1  24.32 
 
 
425 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0940  ABC transporter permease  27.51 
 
 
505 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0613  transmembrane protein Vexp1  22.95 
 
 
425 aa  105  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1013  lipoprotein release ABC transporter permease  28.57 
 
 
406 aa  103  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1142  efflux ABC transporter, permease protein  23.26 
 
 
439 aa  98.2  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0798  hypothetical protein  22.49 
 
 
470 aa  93.6  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2419  hypothetical protein  24.58 
 
 
478 aa  91.3  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00766837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2758  permease, putative  23.59 
 
 
475 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.213868  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5456  hypothetical protein  23.26 
 
 
475 aa  88.2  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2558  ABC transporter, permease protein  22.26 
 
 
474 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00308598 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0682  permease, putative  23.08 
 
 
409 aa  82.8  0.000000000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0619  peptide ABC transporter permease  24.28 
 
 
491 aa  63.5  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.08 
 
 
385 aa  60.5  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0438  peptide ABC transporter permease  26.69 
 
 
485 aa  57.8  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  23.58 
 
 
451 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2096  hypothetical protein  23.85 
 
 
464 aa  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  24.15 
 
 
930 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  23.87 
 
 
484 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2239  protein of unknown function DUF214  34.94 
 
 
774 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  36.84 
 
 
803 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  22.52 
 
 
792 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  25.81 
 
 
410 aa  44.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0730  hypothetical protein  31.31 
 
 
1720 aa  43.5  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1079  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 
419 aa  43.1  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000107767  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  25.51 
 
 
391 aa  43.1  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.63 
 
 
417 aa  42.7  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.8164 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>