109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0307 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  100 
 
 		 410 aa  825    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  62.53 
 
 		 412 aa  503  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  48.78 
 
 		 414 aa  410  1e-113  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  47.52 
 
 		 446 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  49.27 
 
 		 419 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  47.36 
 
 		 419 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  48.32 
 
 		 419 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  46.06 
 
 		 421 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  48.31 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  45.81 
 
 		 421 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  46.06 
 
 		 421 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  44.47 
 
 		 421 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  44.63 
 
 		 421 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  44.23 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  46.31 
 
 		 421 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  43.75 
 
 		 421 aa  363  2e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  44.15 
 
 		 421 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  43.2 
 
 		 421 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  44.47 
 
 		 421 aa  349  6e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  42.96 
 
 		 417 aa  335  7.999999999999999e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  43.54 
 
 		 420 aa  332  8e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  40.57 
 
 		 423 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  41.89 
 
 		 425 aa  315  9.999999999999999e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  41.06 
 
 		 421 aa  313  3.9999999999999997e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  38.46 
 
 		 425 aa  293  3e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  37.44 
 
 		 424 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  39.81 
 
 		 431 aa  259  7e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  31.94 
 
 		 400 aa  179  7e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  32.02 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 		 449 aa  146  8.000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  28.05 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  27.6 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  28.57 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  26.04 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  29.18 
 
 		 399 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  28.88 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  25.3 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  24.32 
 
 		 443 aa  103  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  27.85 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 435 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  34.88 
 
 		 468 aa  93.6  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 		 449 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  22.93 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  30.41 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  24.39 
 
 		 385 aa  60.5  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  31.48 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25 
 
 		 415 aa  54.3  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.63 
 
 		 423 aa  53.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2912  hypothetical protein  23.53 
 
 		 842 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2836  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.87 
 
 		 415 aa  51.2  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.620052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3474  protein of unknown function DUF214  28.83 
 
 		 399 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.81 
 
 		 418 aa  51.2  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  21.76 
 
 		 397 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23230  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  26.05 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000130781  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  23.3 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.3 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  39.44 
 
 		 419 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  27.4 
 
 		 395 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  27.86 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  25.24 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3859  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.07 
 
 		 416 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.09 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  20.22 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  26.48 
 
 		 854 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2211  hypothetical protein  17.89 
 
 		 415 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  21.85 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  20.22 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  22.79 
 
 		 386 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.76 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  33.33 
 
 		 851 aa  47.4  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.35 
 
 		 418 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 		 410 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2239  hypothetical protein  17.89 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1607  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.12 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.345047  normal  0.129769 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.31 
 
 		 397 aa  47  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  22.91 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  31.85 
 
 		 425 aa  47  0.0007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2201  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  22.58 
 
 		 413 aa  47  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  25.25 
 
 		 400 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  35.62 
 
 		 858 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.77 
 
 		 415 aa  46.2  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  22.46 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1986  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.02 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.914701  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10373  ABC transporter efflux protein  21.58 
 
 		 414 aa  45.8  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  22.79 
 
 		 462 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2109  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  20.98 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.93 
 
 		 418 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2395  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  22.89 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  22.34 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  32.53 
 
 		 857 aa  45.8  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  20.92 
 
 		 404 aa  44.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  32.48 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.87 
 
 		 417 aa  44.3  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1171  hypothetical protein  21.99 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.267769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  23.23 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  25.91 
 
 		 387 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02302  ABC-type transport system, permease component  34.69 
 
 		 840 aa  44.3  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  35.94 
 
 		 838 aa  43.9  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.31 
 
 		 386 aa  43.9  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.22 
 
 		 414 aa  43.5  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>