More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_06630 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  80.93 
 
 
421 aa  671    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  81.17 
 
 
421 aa  673    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  77.2 
 
 
421 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  77.67 
 
 
421 aa  665    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  82.19 
 
 
421 aa  698    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  100 
 
 
421 aa  826    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  80.93 
 
 
421 aa  670    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  80.93 
 
 
421 aa  645    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  81.24 
 
 
421 aa  667    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  79.57 
 
 
421 aa  681    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  79.1 
 
 
421 aa  647    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  57.52 
 
 
419 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  58.23 
 
 
421 aa  472  1e-132  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  56.09 
 
 
419 aa  474  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  56.35 
 
 
419 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  54.65 
 
 
420 aa  438  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  53.1 
 
 
421 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  55.05 
 
 
417 aa  424  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  52.73 
 
 
424 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  55.13 
 
 
425 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  44.15 
 
 
414 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  49.64 
 
 
423 aa  391  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  44.6 
 
 
410 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  54.12 
 
 
431 aa  355  5.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  50.73 
 
 
425 aa  355  1e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  43.57 
 
 
412 aa  348  9e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  38.83 
 
 
446 aa  313  3.9999999999999997e-84  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  27.98 
 
 
414 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  29.54 
 
 
449 aa  161  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  31.01 
 
 
400 aa  151  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 
418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 
398 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  31.41 
 
 
400 aa  145  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  34.42 
 
 
422 aa  132  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  27.02 
 
 
425 aa  107  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  28.61 
 
 
435 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  29.24 
 
 
420 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  28.85 
 
 
443 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  27.65 
 
 
399 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  27.65 
 
 
399 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  40.26 
 
 
468 aa  94  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  26.78 
 
 
420 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  28.87 
 
 
472 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  28.72 
 
 
449 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  22.83 
 
 
404 aa  63.2  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  26.21 
 
 
404 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  33.59 
 
 
419 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.77 
 
 
415 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  24.89 
 
 
411 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  23.16 
 
 
408 aa  60.5  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  25.56 
 
 
429 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  25.23 
 
 
408 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  25.94 
 
 
429 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  26.64 
 
 
414 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  26.77 
 
 
407 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.82 
 
 
420 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.68 
 
 
415 aa  58.2  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 
443 aa  57.4  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  22.64 
 
 
395 aa  57  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  25.37 
 
 
414 aa  56.6  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.14 
 
 
424 aa  56.2  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  32.95 
 
 
397 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  22.4 
 
 
371 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  29.86 
 
 
452 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  28.46 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  25.48 
 
 
415 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.71 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.53 
 
 
420 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  26.75 
 
 
418 aa  55.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0163  efflux ABC transporter, permease protein  26.38 
 
 
444 aa  55.1  0.000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  22.7 
 
 
378 aa  54.7  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  27.86 
 
 
414 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  23.77 
 
 
413 aa  54.7  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1985  hypothetical protein  30.05 
 
 
385 aa  54.7  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  23.36 
 
 
386 aa  54.3  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  25 
 
 
404 aa  54.3  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  24.15 
 
 
430 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  38.41 
 
 
849 aa  53.9  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  25.48 
 
 
415 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  24.15 
 
 
430 aa  53.9  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  23.49 
 
 
414 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 
386 aa  53.5  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2497  hypothetical protein  26.85 
 
 
422 aa  53.5  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25.91 
 
 
387 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.92 
 
 
417 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.78 
 
 
421 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  24.6 
 
 
411 aa  52.4  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  29.17 
 
 
408 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  30.51 
 
 
411 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  25.83 
 
 
385 aa  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.45 
 
 
427 aa  51.6  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1986  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.63 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.914701  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 
387 aa  51.2  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1676  protein of unknown function DUF214  26.57 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  26.67 
 
 
415 aa  51.2  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.75 
 
 
419 aa  50.8  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  29.91 
 
 
410 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  28.23 
 
 
662 aa  51.2  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  33.79 
 
 
488 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>