245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5020 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 418 aa  839    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  62.77 
 
 		 414 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  43.78 
 
 		 398 aa  345  6e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  38.11 
 
 		 400 aa  285  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  38.55 
 
 		 400 aa  269  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  39.95 
 
 		 422 aa  257  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  37.39 
 
 		 468 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  31.93 
 
 		 449 aa  202  9e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  29.29 
 
 		 421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  29.31 
 
 		 419 aa  187  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  29.29 
 
 		 419 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  28.81 
 
 		 421 aa  179  9e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  28.81 
 
 		 421 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  29.13 
 
 		 421 aa  176  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  29.03 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  27.87 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  28.1 
 
 		 421 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  27.95 
 
 		 421 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  27.95 
 
 		 421 aa  166  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  27.95 
 
 		 421 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  26 
 
 		 414 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  28.04 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  26.72 
 
 		 423 aa  160  5e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  29.59 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  26.94 
 
 		 417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  26.32 
 
 		 412 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  27.71 
 
 		 421 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  29.27 
 
 		 421 aa  146  7.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  25 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  25.87 
 
 		 424 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  28.35 
 
 		 425 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  27.32 
 
 		 435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  26.57 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  25.73 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  28.75 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  27.35 
 
 		 399 aa  117  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  27.35 
 
 		 399 aa  116  6.9999999999999995e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  28.04 
 
 		 425 aa  113  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  27.93 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  23.59 
 
 		 443 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  25.06 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  23.81 
 
 		 420 aa  101  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  34.57 
 
 		 449 aa  94  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2173  hypothetical protein  25.32 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  20.24 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  37.88 
 
 		 930 aa  60.8  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  20.32 
 
 		 407 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  22.2 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  37.01 
 
 		 836 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  24.83 
 
 		 399 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  21.38 
 
 		 417 aa  58.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  21.35 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  24.87 
 
 		 825 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  25.7 
 
 		 385 aa  57  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  23.95 
 
 		 409 aa  56.6  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  24.82 
 
 		 411 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  27.13 
 
 		 640 aa  55.5  0.000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  37.5 
 
 		 871 aa  54.7  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  20.43 
 
 		 415 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  20.07 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  20.14 
 
 		 414 aa  53.9  0.000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  25.67 
 
 		 397 aa  53.9  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1860  PglC  26.71 
 
 		 399 aa  53.1  0.000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000429042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  31.54 
 
 		 857 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.71 
 
 		 418 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  24.07 
 
 		 403 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0086  hypothetical protein  30.65 
 
 		 438 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  27.74 
 
 		 646 aa  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  27.21 
 
 		 843 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0939  lipoprotein release system transmembrane protein  27.21 
 
 		 396 aa  52  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.866637  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  27.34 
 
 		 641 aa  51.6  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  20.65 
 
 		 378 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  24.08 
 
 		 386 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  27.34 
 
 		 641 aa  51.2  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2729  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 		 796 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  29.23 
 
 		 842 aa  50.8  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  27.42 
 
 		 413 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  22.74 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  26.56 
 
 		 641 aa  50.4  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  34.88 
 
 		 842 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  21.64 
 
 		 654 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  26.97 
 
 		 396 aa  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  34.88 
 
 		 842 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  23.67 
 
 		 413 aa  50.1  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  21.23 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  34.88 
 
 		 842 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  28.68 
 
 		 821 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 		 452 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  24.16 
 
 		 654 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  27.64 
 
 		 849 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.8 
 
 		 443 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0795  ABC transporter, permease protein  24.71 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.372785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  28.46 
 
 		 849 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  29.56 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  31.54 
 
 		 858 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  26.56 
 
 		 643 aa  48.5  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  23.29 
 
 		 386 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.97 
 
 		 880 aa  48.5  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>