187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2157 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
417 aa  820    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  55.77 
 
 
421 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  54.57 
 
 
421 aa  455  1e-127  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  54.33 
 
 
421 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  56.59 
 
 
421 aa  450  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  54.33 
 
 
421 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  54.57 
 
 
421 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  54.93 
 
 
421 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  54.68 
 
 
421 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  54.68 
 
 
421 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  55.67 
 
 
421 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  54.93 
 
 
421 aa  415  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  49.28 
 
 
419 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  50.24 
 
 
421 aa  397  1e-109  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  51.32 
 
 
425 aa  387  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  47.09 
 
 
419 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  47.39 
 
 
419 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  48.32 
 
 
423 aa  380  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  48.92 
 
 
420 aa  378  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  48.43 
 
 
421 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  41.71 
 
 
414 aa  360  3e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  46.06 
 
 
424 aa  350  4e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  51.66 
 
 
431 aa  342  8e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  44.05 
 
 
410 aa  341  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  48.4 
 
 
425 aa  340  2.9999999999999998e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  42.65 
 
 
412 aa  333  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  37.5 
 
 
446 aa  296  5e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  26.7 
 
 
414 aa  163  7e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  27.98 
 
 
418 aa  149  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 
449 aa  146  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  30.15 
 
 
400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  25.89 
 
 
398 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  29.71 
 
 
400 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  32.16 
 
 
422 aa  138  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  29.63 
 
 
435 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  37.57 
 
 
468 aa  104  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  30.16 
 
 
420 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  28.65 
 
 
420 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  27.35 
 
 
399 aa  99.8  8e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  27.35 
 
 
399 aa  99.8  9e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  26.9 
 
 
443 aa  99  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  26.06 
 
 
425 aa  93.6  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  27.18 
 
 
472 aa  64.3  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  25.13 
 
 
385 aa  61.6  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0410  hypothetical protein  23.94 
 
 
397 aa  59.7  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.534862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  26.95 
 
 
449 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  24.41 
 
 
397 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.48 
 
 
397 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  25.71 
 
 
386 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1792  hypothetical protein  23.81 
 
 
397 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0323827  unclonable  0.00000000701935 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  21.5 
 
 
642 aa  53.9  0.000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  39 
 
 
843 aa  53.5  0.000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1135  hypothetical protein  23.81 
 
 
397 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.5 
 
 
416 aa  53.1  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2173  hypothetical protein  24.53 
 
 
393 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  25.62 
 
 
386 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  23.58 
 
 
397 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1528  hypothetical protein  25.77 
 
 
409 aa  52  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.275544 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1076  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.98 
 
 
416 aa  51.2  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0609031  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1075  hypothetical protein  30.47 
 
 
828 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.278561  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1207  protein of unknown function DUF214  26.98 
 
 
655 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1989  hypothetical protein  28.17 
 
 
827 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.662339  normal  0.457189 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2537  hypothetical protein  33.05 
 
 
793 aa  50.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.22202  hitchhiker  0.0000000191831 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1079  hypothetical protein  26.48 
 
 
655 aa  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  29.27 
 
 
1207 aa  50.1  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.64 
 
 
420 aa  49.7  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  22.04 
 
 
404 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0944  hypothetical protein  31.45 
 
 
853 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.69332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2050  hypothetical protein  31.67 
 
 
870 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300889  normal  0.913564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2257  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  21.76 
 
 
410 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  24.57 
 
 
657 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  26.94 
 
 
386 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2785  protein of unknown function DUF214  35.34 
 
 
857 aa  48.5  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.482364  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  23.02 
 
 
402 aa  48.9  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 
386 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3458  hypothetical protein  35.34 
 
 
857 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.840481  normal  0.470717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4056  protein of unknown function DUF214  33.88 
 
 
838 aa  48.5  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0960  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.66 
 
 
416 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0846  hypothetical protein  35.19 
 
 
858 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  22.49 
 
 
397 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  22.16 
 
 
395 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1056  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.66 
 
 
416 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.504254 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0465  protein of unknown function DUF214  22.41 
 
 
410 aa  47.4  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  22.86 
 
 
657 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1954  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.78 
 
 
410 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00124198  normal  0.0910172 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1138  protein of unknown function DUF214  26.98 
 
 
658 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3255  hypothetical protein  32.17 
 
 
839 aa  47.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0335123  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  24.32 
 
 
430 aa  47.4  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  30.65 
 
 
840 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  29.06 
 
 
381 aa  47.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  22.75 
 
 
386 aa  47.4  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  32.37 
 
 
412 aa  47  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1613  protein of unknown function DUF214  30.16 
 
 
779 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442641  normal  0.0478935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1117  lipoprotein releasing system transmembrane  23.63 
 
 
416 aa  47  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0172186  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  31.01 
 
 
645 aa  47  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.21 
 
 
416 aa  47  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  23.41 
 
 
642 aa  47  0.0007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.83 
 
 
397 aa  47  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2393  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.78 
 
 
410 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000160813  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1156  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.32 
 
 
417 aa  46.6  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.342008  normal  0.0203303 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>