55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_4111 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 449 aa  896    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  84.62 
 
 		 472 aa  711    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  50.33 
 
 		 443 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  48.98 
 
 		 435 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  48.08 
 
 		 425 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  49.21 
 
 		 420 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  47.19 
 
 		 420 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  28.38 
 
 		 449 aa  129  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  24.66 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  38.14 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  38.14 
 
 		 399 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  27.89 
 
 		 414 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  24.67 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  24.89 
 
 		 410 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  27.68 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  25.78 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  26.38 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  28.47 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  26.46 
 
 		 421 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  24.5 
 
 		 423 aa  99.4  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  26.64 
 
 		 421 aa  97.8  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  27.58 
 
 		 421 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  26.32 
 
 		 422 aa  97.4  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  26.77 
 
 		 421 aa  96.7  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  26.99 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  26.61 
 
 		 418 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  22.94 
 
 		 419 aa  92.4  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  27.46 
 
 		 400 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  26.94 
 
 		 420 aa  89.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  24.01 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  23.79 
 
 		 419 aa  88.2  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  25.68 
 
 		 421 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  24.66 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  31.36 
 
 		 468 aa  85.9  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  27.23 
 
 		 421 aa  80.5  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  29.53 
 
 		 412 aa  80.1  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  25 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  25.71 
 
 		 421 aa  76.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  31.15 
 
 		 425 aa  70.5  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  27.75 
 
 		 421 aa  70.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  22.69 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  25.59 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  22.7 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  25.22 
 
 		 431 aa  52.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1074  hypothetical protein  25.74 
 
 		 866 aa  47.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.66 
 
 		 419 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  30.3 
 
 		 413 aa  47  0.0007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 		 400 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  24.32 
 
 		 885 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  26.06 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  33.6 
 
 		 404 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.39 
 
 		 413 aa  44.3  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2173  hypothetical protein  21.75 
 
 		 393 aa  44.3  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  29.06 
 
 		 407 aa  43.9  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0268  ABC-type transport system, permease component  28.28 
 
 		 417 aa  43.1  0.01  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>