75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1074 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_1074  hypothetical protein  100 
 
 
866 aa  1682    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0224  hypothetical protein  31.18 
 
 
852 aa  411  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0222  hypothetical protein  31.18 
 
 
852 aa  411  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0430  hypothetical protein  26.05 
 
 
884 aa  265  3e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1028  hypothetical protein  27.81 
 
 
854 aa  261  4e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  22.98 
 
 
897 aa  64.3  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  29.67 
 
 
421 aa  57.8  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  21.87 
 
 
852 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1776  hypothetical protein  25.7 
 
 
383 aa  56.2  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  20.74 
 
 
851 aa  53.5  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3417  hypothetical protein  23.58 
 
 
621 aa  53.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.603492  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3258  hypothetical protein  26.5 
 
 
399 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  22.47 
 
 
850 aa  52.8  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3720  hypothetical protein  26.96 
 
 
403 aa  52  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  26.8 
 
 
662 aa  51.6  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  26.22 
 
 
408 aa  51.2  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1087  hypothetical protein  30 
 
 
414 aa  50.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  33.56 
 
 
421 aa  50.8  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0900  hypothetical protein  27.35 
 
 
402 aa  50.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.886297  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  21.2 
 
 
404 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1915  hypothetical protein  30.14 
 
 
414 aa  49.7  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2848  hypothetical protein  26.96 
 
 
402 aa  50.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0725  hypothetical protein  26.09 
 
 
398 aa  50.1  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 
846 aa  49.3  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3275  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.67 
 
 
422 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  23.36 
 
 
848 aa  49.7  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  30.71 
 
 
414 aa  49.3  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1040  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.59 
 
 
416 aa  48.9  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.678846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2862  hypothetical protein  24.79 
 
 
405 aa  48.9  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4530  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.31 
 
 
426 aa  48.5  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  21.81 
 
 
407 aa  48.5  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  20.42 
 
 
822 aa  48.5  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.54 
 
 
426 aa  48.5  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  23.96 
 
 
387 aa  48.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1676  hypothetical protein  28.87 
 
 
412 aa  48.1  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.503245  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.45 
 
 
422 aa  48.1  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  21.69 
 
 
871 aa  48.1  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.13 
 
 
426 aa  48.1  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.172929  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  24.91 
 
 
417 aa  47.8  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1076  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.83 
 
 
416 aa  47.8  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0609031  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  29.08 
 
 
415 aa  47.4  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 
838 aa  47.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  22.27 
 
 
396 aa  47.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2598  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.45 
 
 
426 aa  47.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  28.7 
 
 
430 aa  47  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2978  hypothetical protein  20.72 
 
 
419 aa  46.6  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.231225  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  24.18 
 
 
930 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0137  putative permease  23.1 
 
 
407 aa  46.6  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4642  ABC transporter permease  29.49 
 
 
619 aa  46.2  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4996  ABC transporter permease  29.49 
 
 
619 aa  46.2  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  27.6 
 
 
413 aa  46.2  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.96 
 
 
414 aa  46.2  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2428  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.31 
 
 
426 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507047  normal  0.0670699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  19.12 
 
 
847 aa  45.8  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1918  protein of unknown function DUF214  22.09 
 
 
844 aa  45.4  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00532118  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  26.13 
 
 
859 aa  45.8  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4575  hypothetical protein  21.88 
 
 
619 aa  45.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  21.38 
 
 
664 aa  45.4  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0483  hypothetical protein  29.91 
 
 
373 aa  45.8  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3938  hypothetical protein  22.84 
 
 
414 aa  45.4  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158906  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  21.92 
 
 
858 aa  45.4  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3567  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  21.65 
 
 
423 aa  45.4  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.756596  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  21.58 
 
 
853 aa  45.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3157  hypothetical protein  26.5 
 
 
399 aa  45.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  22.18 
 
 
836 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2207  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit LolC  21.65 
 
 
399 aa  45.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.014511  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  26.9 
 
 
779 aa  45.1  0.006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0865  hypothetical protein  26.5 
 
 
399 aa  45.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3859  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.4 
 
 
416 aa  44.7  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0429  hydrogenase 4 membrane subunit  35 
 
 
380 aa  44.7  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0100883  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  24.27 
 
 
861 aa  44.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  32.48 
 
 
413 aa  44.7  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  25 
 
 
804 aa  44.7  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  26.55 
 
 
421 aa  44.3  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1199  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  19.75 
 
 
416 aa  44.3  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.132324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>