50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1028 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0430  hypothetical protein  42.71 
 
 		 884 aa  671    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1028  hypothetical protein  100 
 
 		 854 aa  1657    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1074  hypothetical protein  27.81 
 
 		 866 aa  269  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0224  hypothetical protein  26.74 
 
 		 852 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0222  hypothetical protein  26.74 
 
 		 852 aa  264  4.999999999999999e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  29.89 
 
 		 897 aa  65.1  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  29.1 
 
 		 871 aa  60.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  25.83 
 
 		 853 aa  60.1  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.68 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  27.18 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  24.87 
 
 		 857 aa  58.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  26.22 
 
 		 858 aa  58.2  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  18.43 
 
 		 821 aa  58.2  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0483  hypothetical protein  25.21 
 
 		 373 aa  58.2  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  24.44 
 
 		 878 aa  56.2  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  24.02 
 
 		 847 aa  56.2  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  29.5 
 
 		 850 aa  55.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  23.55 
 
 		 851 aa  55.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  25.56 
 
 		 855 aa  54.3  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  29.06 
 
 		 846 aa  54.3  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  23.66 
 
 		 852 aa  53.5  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  21.49 
 
 		 828 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  21.05 
 
 		 855 aa  51.6  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2079  hypothetical protein  20.63 
 
 		 896 aa  51.6  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0252842  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  39.19 
 
 		 850 aa  51.2  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  24.55 
 
 		 854 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  18.65 
 
 		 841 aa  50.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  34.91 
 
 		 413 aa  50.1  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2709  protein of unknown function DUF214  29.41 
 
 		 287 aa  49.7  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 		 930 aa  49.3  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  32.85 
 
 		 410 aa  48.5  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  23.01 
 
 		 855 aa  48.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  28.68 
 
 		 849 aa  48.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  26.04 
 
 		 856 aa  47.8  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 		 404 aa  47  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  23.45 
 
 		 386 aa  47.4  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 		 849 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  30.17 
 
 		 395 aa  47.4  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  26.74 
 
 		 466 aa  47  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  18.66 
 
 		 399 aa  46.6  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.41 
 
 		 437 aa  45.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0217  hypothetical protein  22.6 
 
 		 788 aa  45.1  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0100  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 		 1193 aa  45.1  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  30.4 
 
 		 421 aa  45.1  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  20.35 
 
 		 863 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  24.55 
 
 		 397 aa  45.1  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 		 429 aa  44.7  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  21.68 
 
 		 873 aa  44.3  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  38 
 
 		 903 aa  44.3  0.01  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  22.13 
 
 		 788 aa  44.3  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>