54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0430 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0430  hypothetical protein  100 
 
 
884 aa  1721    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1028  hypothetical protein  42.71 
 
 
854 aa  647    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0222  hypothetical protein  26.94 
 
 
852 aa  278  2e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0224  hypothetical protein  26.94 
 
 
852 aa  278  2e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1074  hypothetical protein  25.42 
 
 
866 aa  253  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0100  protein of unknown function DUF214  30.95 
 
 
1193 aa  54.7  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  21.77 
 
 
836 aa  54.7  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3258  hypothetical protein  32.69 
 
 
399 aa  52.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  22.61 
 
 
853 aa  52  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.24 
 
 
423 aa  52  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  24.06 
 
 
412 aa  50.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  26.44 
 
 
897 aa  48.9  0.0004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  29.2 
 
 
841 aa  48.9  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  29.58 
 
 
415 aa  48.5  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  27.34 
 
 
423 aa  48.1  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0725  hypothetical protein  26.92 
 
 
398 aa  47.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  27.05 
 
 
421 aa  47.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  35.62 
 
 
854 aa  47  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3720  hypothetical protein  28.85 
 
 
403 aa  47.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_002950  PG0280  ABC transporter, permease protein, putative  28.57 
 
 
442 aa  47  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  21.9 
 
 
859 aa  46.2  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0895  hypothetical protein  25.94 
 
 
400 aa  46.6  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00465052  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25 
 
 
424 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  30.86 
 
 
387 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  22.93 
 
 
852 aa  46.2  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0865  hypothetical protein  31.73 
 
 
399 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3157  hypothetical protein  31.73 
 
 
399 aa  46.2  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  29.13 
 
 
855 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  29.91 
 
 
861 aa  46.2  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  28.49 
 
 
847 aa  46.2  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.76 
 
 
648 aa  45.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1384  hypothetical protein  30.51 
 
 
405 aa  45.8  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  21.97 
 
 
821 aa  45.8  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  27.86 
 
 
378 aa  45.4  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  21.31 
 
 
825 aa  45.1  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2848  hypothetical protein  29.81 
 
 
402 aa  45.4  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  21.19 
 
 
838 aa  45.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  22.38 
 
 
395 aa  45.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0906  hypothetical protein  24.32 
 
 
362 aa  45.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.831415  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  29.46 
 
 
885 aa  45.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1840  protein of unknown function DUF214  32.65 
 
 
408 aa  45.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  22.28 
 
 
395 aa  45.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  30.97 
 
 
1090 aa  44.7  0.007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  30 
 
 
400 aa  44.7  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4682  hypothetical protein  24.04 
 
 
659 aa  44.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  23.97 
 
 
415 aa  45.1  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  25.62 
 
 
417 aa  44.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  24.59 
 
 
421 aa  44.7  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  26.76 
 
 
858 aa  44.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 
405 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  24.22 
 
 
405 aa  44.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  23.75 
 
 
642 aa  44.3  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  20.9 
 
 
351 aa  44.3  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  20.9 
 
 
351 aa  44.3  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>