More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0725 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0725  hypothetical protein  100 
 
 		 398 aa  811    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1000  hypothetical protein  74.44 
 
 		 399 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1033  hypothetical protein  74.44 
 
 		 399 aa  550  1e-155  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1021  protein of unknown function DUF214  75.44 
 
 		 399 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3339  hypothetical protein  75.44 
 
 		 399 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2989  hypothetical protein  72.68 
 
 		 399 aa  528  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0900  hypothetical protein  62.94 
 
 		 402 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.886297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2848  hypothetical protein  65.84 
 
 		 402 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3720  hypothetical protein  60.55 
 
 		 403 aa  441  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3258  hypothetical protein  59.75 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4070  hypothetical protein  60.15 
 
 		 404 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3690  ABC transporter, permease protein  60.5 
 
 		 399 aa  423  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2862  hypothetical protein  52.84 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0865  hypothetical protein  60.25 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3157  hypothetical protein  60.25 
 
 		 399 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3362  hypothetical protein  58.81 
 
 		 403 aa  387  1e-106  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2408  hypothetical protein  36.48 
 
 		 417 aa  234  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2241  hypothetical protein  33.17 
 
 		 408 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3503  protein of unknown function DUF214  31.37 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.570589  normal  0.23151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0575  putative ABC transporter, permease protein  26.76 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.76 
 
 		 805 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  25.45 
 
 		 803 aa  110  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  23.82 
 
 		 831 aa  106  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.44 
 
 		 813 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.2 
 
 		 849 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  25.45 
 
 		 821 aa  99.4  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  24.68 
 
 		 869 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.69 
 
 		 807 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  23.72 
 
 		 814 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.24 
 
 		 807 aa  97.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  22.76 
 
 		 797 aa  96.3  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.14 
 
 		 816 aa  96.3  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.54 
 
 		 882 aa  96.3  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  26.79 
 
 		 805 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  26.43 
 
 		 656 aa  94.4  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  25.89 
 
 		 648 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  25.89 
 
 		 648 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  23.54 
 
 		 805 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  24.62 
 
 		 802 aa  93.6  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.41 
 
 		 817 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  24.63 
 
 		 804 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 		 407 aa  91.3  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  26.71 
 
 		 647 aa  89  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  22.56 
 
 		 796 aa  89.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.86 
 
 		 878 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.36 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.76 
 
 		 656 aa  87.8  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  27.49 
 
 		 810 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  26.18 
 
 		 647 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  25.61 
 
 		 682 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  25.61 
 
 		 682 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  25.61 
 
 		 667 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  25.61 
 
 		 667 aa  87  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  25.25 
 
 		 809 aa  86.3  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2348  protein of unknown function DUF214  23.25 
 
 		 384 aa  86.3  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.555804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  22.39 
 
 		 649 aa  86.3  9e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  24.79 
 
 		 817 aa  86.3  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.02 
 
 		 642 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  24.07 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.66 
 
 		 809 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  25.7 
 
 		 804 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  25.94 
 
 		 800 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  27.5 
 
 		 646 aa  84.7  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 		 805 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  25 
 
 		 650 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.18 
 
 		 913 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  25.19 
 
 		 795 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  28.23 
 
 		 653 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.69 
 
 		 653 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.69 
 
 		 653 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.42 
 
 		 822 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  26 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.69 
 
 		 653 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  26.69 
 
 		 653 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  22.92 
 
 		 802 aa  83.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.07 
 
 		 823 aa  83.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5613  protein of unknown function DUF214  23.15 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  26.74 
 
 		 687 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  25.37 
 
 		 642 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.32 
 
 		 648 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  25.8 
 
 		 640 aa  81.3  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  25.09 
 
 		 648 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  24.73 
 
 		 807 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  26.09 
 
 		 373 aa  79.7  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  26.09 
 
 		 681 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.13 
 
 		 862 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  25.19 
 
 		 798 aa  79.7  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  25.96 
 
 		 804 aa  79.7  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.75 
 
 		 649 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  25.39 
 
 		 792 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  24.83 
 
 		 411 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.75 
 
 		 649 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  26.09 
 
 		 681 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  23.91 
 
 		 809 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  26.87 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  23.99 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  26.17 
 
 		 678 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.5 
 
 		 893 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  26.17 
 
 		 678 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  23.08 
 
 		 808 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>