More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4070 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4070  hypothetical protein  100 
 
 		 404 aa  823    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3720  hypothetical protein  74.5 
 
 		 403 aa  587  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3362  hypothetical protein  69.8 
 
 		 403 aa  498  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0725  hypothetical protein  60.15 
 
 		 398 aa  449  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3258  hypothetical protein  58.42 
 
 		 399 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1033  hypothetical protein  59.41 
 
 		 399 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1000  hypothetical protein  59.41 
 
 		 399 aa  430  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0900  hypothetical protein  54.07 
 
 		 402 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.886297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3690  ABC transporter, permease protein  58.42 
 
 		 399 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2848  hypothetical protein  54.46 
 
 		 402 aa  421  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0865  hypothetical protein  59.41 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3157  hypothetical protein  59.41 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3339  hypothetical protein  59.16 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1021  protein of unknown function DUF214  59.16 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2989  hypothetical protein  57.92 
 
 		 399 aa  402  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2862  hypothetical protein  49.39 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2408  hypothetical protein  33.42 
 
 		 417 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2241  hypothetical protein  31.73 
 
 		 408 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3503  protein of unknown function DUF214  30.79 
 
 		 405 aa  181  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.570589  normal  0.23151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0575  putative ABC transporter, permease protein  23.04 
 
 		 404 aa  117  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  25.35 
 
 		 831 aa  97.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.38 
 
 		 807 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  26.88 
 
 		 648 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  26.88 
 
 		 648 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  24.69 
 
 		 668 aa  89.7  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  24.69 
 
 		 668 aa  89.7  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  27.05 
 
 		 405 aa  88.6  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  25.09 
 
 		 652 aa  87  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  21.99 
 
 		 796 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  26.12 
 
 		 667 aa  87  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  25.89 
 
 		 646 aa  87  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  26.12 
 
 		 667 aa  86.7  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 		 802 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.77 
 
 		 813 aa  86.3  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  25.71 
 
 		 682 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  26.18 
 
 		 649 aa  85.9  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.27 
 
 		 913 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.21 
 
 		 849 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  25.71 
 
 		 682 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  25.9 
 
 		 696 aa  84.7  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.23 
 
 		 656 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  25.51 
 
 		 656 aa  84  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  26.18 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.4 
 
 		 915 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  25.75 
 
 		 650 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  25.25 
 
 		 803 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  25.85 
 
 		 647 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  24.94 
 
 		 804 aa  79.7  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  25 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  24.92 
 
 		 653 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  26.28 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.94 
 
 		 816 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  25.7 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  24.21 
 
 		 648 aa  78.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 		 398 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  23.79 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  25.61 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  26.16 
 
 		 804 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.22 
 
 		 649 aa  77  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  24.01 
 
 		 647 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.5 
 
 		 805 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.75 
 
 		 648 aa  75.9  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  22.26 
 
 		 640 aa  76.3  0.000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  26.21 
 
 		 806 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.43 
 
 		 820 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  23.19 
 
 		 808 aa  75.5  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.78 
 
 		 649 aa  75.9  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  21.98 
 
 		 814 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  22.88 
 
 		 642 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.86 
 
 		 807 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  23.74 
 
 		 803 aa  75.1  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  26.48 
 
 		 409 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  29.07 
 
 		 409 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2467  ABC transporter related  28.49 
 
 		 650 aa  74.7  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.385523  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 		 401 aa  74.3  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1761  hypothetical protein  26.25 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000119528  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  24.26 
 
 		 784 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  26.03 
 
 		 678 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5613  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.03 
 
 		 678 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  26.03 
 
 		 678 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  25.82 
 
 		 798 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  26.3 
 
 		 656 aa  73.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  22.49 
 
 		 641 aa  73.6  0.000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  27.13 
 
 		 406 aa  73.9  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  22.06 
 
 		 805 aa  73.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.51 
 
 		 893 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  23.12 
 
 		 797 aa  73.6  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3413  hypothetical protein  30.3 
 
 		 373 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.779659  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  30.3 
 
 		 681 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  30.3 
 
 		 681 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  21.52 
 
 		 802 aa  73.2  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.93 
 
 		 805 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7079  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 452 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  24.1 
 
 		 653 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.67 
 
 		 855 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3371  protein of unknown function DUF214  26.01 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.270036  normal  0.137006 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  29.55 
 
 		 687 aa  72  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  24.31 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  23.59 
 
 		 810 aa  72  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>