More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2989 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1033  hypothetical protein  92.48 
 
 		 399 aa  701    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1021  protein of unknown function DUF214  94.49 
 
 		 399 aa  689    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1000  hypothetical protein  92.48 
 
 		 399 aa  701    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2989  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  810    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3339  hypothetical protein  94.49 
 
 		 399 aa  689    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0725  hypothetical protein  72.68 
 
 		 398 aa  565  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0900  hypothetical protein  65.01 
 
 		 402 aa  525  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.886297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2848  hypothetical protein  68.16 
 
 		 402 aa  512  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3258  hypothetical protein  63.59 
 
 		 399 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3690  ABC transporter, permease protein  64.09 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3720  hypothetical protein  60.79 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0865  hypothetical protein  64.34 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3157  hypothetical protein  64.34 
 
 		 399 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2862  hypothetical protein  53.33 
 
 		 405 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4070  hypothetical protein  57.92 
 
 		 404 aa  420  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3362  hypothetical protein  61.29 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2408  hypothetical protein  36.45 
 
 		 417 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2241  hypothetical protein  31.78 
 
 		 408 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3503  protein of unknown function DUF214  32.74 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.570589  normal  0.23151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0575  putative ABC transporter, permease protein  25.42 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.17 
 
 		 816 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  27.92 
 
 		 803 aa  103  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.56 
 
 		 805 aa  102  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  23.1 
 
 		 797 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.04 
 
 		 817 aa  98.6  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  23.28 
 
 		 831 aa  98.6  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  24.43 
 
 		 869 aa  98.2  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  24.62 
 
 		 821 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  28.23 
 
 		 810 aa  93.2  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.18 
 
 		 807 aa  93.6  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  26.98 
 
 		 809 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  23.63 
 
 		 805 aa  89.7  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  23.48 
 
 		 802 aa  89.4  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  25.23 
 
 		 647 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  26.84 
 
 		 810 aa  88.2  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  27.06 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  23.57 
 
 		 648 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  23.57 
 
 		 648 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  26.42 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  24.68 
 
 		 804 aa  86.7  8e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.83 
 
 		 648 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.86 
 
 		 893 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  25.42 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  27.18 
 
 		 795 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.19 
 
 		 823 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  23.56 
 
 		 814 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  22.28 
 
 		 805 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  27.51 
 
 		 646 aa  84.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  29.04 
 
 		 417 aa  83.6  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.27 
 
 		 646 aa  83.6  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.34 
 
 		 813 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.24 
 
 		 882 aa  82.8  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  21.65 
 
 		 802 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  25.82 
 
 		 653 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.23 
 
 		 862 aa  81.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  26.55 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  24.66 
 
 		 656 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  26.33 
 
 		 648 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.33 
 
 		 405 aa  80.9  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  21.97 
 
 		 796 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  25.1 
 
 		 682 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  25.1 
 
 		 682 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  25.1 
 
 		 667 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  25.1 
 
 		 667 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.6 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  24.61 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.66 
 
 		 807 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  25.76 
 
 		 795 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  27.04 
 
 		 411 aa  80.1  0.00000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 421 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  23.93 
 
 		 642 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  32 
 
 		 696 aa  79.7  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  26.22 
 
 		 641 aa  79.7  0.00000000000009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.82 
 
 		 656 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.83 
 
 		 648 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.64 
 
 		 648 aa  79.7  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  23.63 
 
 		 808 aa  79  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.83 
 
 		 648 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.83 
 
 		 648 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.21 
 
 		 649 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.83 
 
 		 648 aa  79.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  26.22 
 
 		 641 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  24.06 
 
 		 798 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  26.17 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  24.64 
 
 		 640 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  31.21 
 
 		 649 aa  78.6  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  26.22 
 
 		 641 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  25.06 
 
 		 844 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  21.74 
 
 		 800 aa  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  23.26 
 
 		 817 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  23.05 
 
 		 809 aa  78.2  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  26.84 
 
 		 666 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  25.19 
 
 		 816 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00884  fused macrolide transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding component/membrane component  25.87 
 
 		 648 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2763  ABC transporter related protein  25.87 
 
 		 648 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0279159  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2717  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.87 
 
 		 648 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  27.21 
 
 		 887 aa  77  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00890  hypothetical protein  25.87 
 
 		 648 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.646648  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2450  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.87 
 
 		 648 aa  77  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0569677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0983  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25.87 
 
 		 648 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0183983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>