More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3339 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1000  hypothetical protein  96.99 
 
 
399 aa  731    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1033  hypothetical protein  96.99 
 
 
399 aa  731    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1021  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
399 aa  806    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3339  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  806    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2989  hypothetical protein  94.49 
 
 
399 aa  688    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0725  hypothetical protein  75.44 
 
 
398 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0900  hypothetical protein  66 
 
 
402 aa  532  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.886297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2848  hypothetical protein  70.15 
 
 
402 aa  523  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3258  hypothetical protein  64.34 
 
 
399 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3690  ABC transporter, permease protein  64.84 
 
 
399 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3720  hypothetical protein  62.78 
 
 
403 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0865  hypothetical protein  65.09 
 
 
399 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3157  hypothetical protein  65.09 
 
 
399 aa  449  1e-125  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2862  hypothetical protein  54.07 
 
 
405 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4070  hypothetical protein  59.16 
 
 
404 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3362  hypothetical protein  61.79 
 
 
403 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2408  hypothetical protein  36.39 
 
 
417 aa  238  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2241  hypothetical protein  32.6 
 
 
408 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3503  protein of unknown function DUF214  32.06 
 
 
405 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.570589  normal  0.23151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.47 
 
 
816 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  23.86 
 
 
797 aa  113  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.77 
 
 
805 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  24.82 
 
 
831 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0575  putative ABC transporter, permease protein  25.18 
 
 
404 aa  111  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  25.63 
 
 
869 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  25.21 
 
 
805 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  27.14 
 
 
803 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.07 
 
 
807 aa  101  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  27.93 
 
 
809 aa  99  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.26 
 
 
817 aa  97.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  24.87 
 
 
821 aa  96.3  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  26.12 
 
 
798 aa  95.1  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  23.38 
 
 
805 aa  93.2  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.6 
 
 
823 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  25.89 
 
 
804 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  24.76 
 
 
814 aa  91.7  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  24.18 
 
 
802 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  27.39 
 
 
810 aa  91.3  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  26.34 
 
 
647 aa  90.1  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  24.48 
 
 
648 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  24.48 
 
 
648 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 
417 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  28.32 
 
 
646 aa  88.2  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  27.11 
 
 
810 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  27.51 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  25 
 
 
648 aa  87.8  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  25.94 
 
 
407 aa  87.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  22.76 
 
 
800 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.05 
 
 
893 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  23.06 
 
 
796 aa  86.3  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.37 
 
 
862 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.47 
 
 
807 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.92 
 
 
882 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.33 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  24.91 
 
 
642 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  27.1 
 
 
803 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  22.42 
 
 
802 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  24.02 
 
 
421 aa  84  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.93 
 
 
878 aa  84  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2316  ABC transporter related  27.76 
 
 
648 aa  83.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.999861  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  25.75 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  24.38 
 
 
640 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 
805 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2348  protein of unknown function DUF214  25.85 
 
 
384 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.555804  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  25.58 
 
 
813 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  25.79 
 
 
844 aa  81.6  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.36 
 
 
813 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.65 
 
 
883 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.96 
 
 
437 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.45 
 
 
809 aa  82  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  25 
 
 
650 aa  81.3  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.25 
 
 
849 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  26.94 
 
 
666 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.3 
 
 
642 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  25.44 
 
 
806 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  26.4 
 
 
795 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  27.09 
 
 
410 aa  80.5  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.54 
 
 
656 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  24.49 
 
 
804 aa  80.1  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  26.82 
 
 
410 aa  80.1  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  27.88 
 
 
406 aa  79.7  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  26.76 
 
 
641 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  26.6 
 
 
641 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  26.57 
 
 
421 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  28.4 
 
 
806 aa  79.3  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  24.62 
 
 
817 aa  79  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1485  protein of unknown function DUF214  30.17 
 
 
417 aa  79  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.608649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  27.3 
 
 
655 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  23.94 
 
 
649 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  25.45 
 
 
652 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  26.97 
 
 
408 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  25.66 
 
 
649 aa  78.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  25.22 
 
 
653 aa  78.2  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  25.29 
 
 
647 aa  78.6  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.94 
 
 
915 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.01 
 
 
646 aa  79  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  25.63 
 
 
795 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  26.04 
 
 
421 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  27.11 
 
 
641 aa  78.6  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  32 
 
 
696 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>