More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0575 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0575  putative ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 404 aa  815    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2241  hypothetical protein  26.39 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2862  hypothetical protein  26.78 
 
 		 405 aa  137  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0900  hypothetical protein  26.41 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.886297  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2848  hypothetical protein  26.1 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0725  hypothetical protein  26.76 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2408  hypothetical protein  24.57 
 
 		 417 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3503  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.570589  normal  0.23151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3258  hypothetical protein  25.42 
 
 		 399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3720  hypothetical protein  23.19 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3690  ABC transporter, permease protein  25.42 
 
 		 399 aa  99.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  24.21 
 
 		 802 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0865  hypothetical protein  24.94 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3157  hypothetical protein  24.94 
 
 		 399 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4070  hypothetical protein  23.04 
 
 		 404 aa  94.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  23.7 
 
 		 797 aa  90.5  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1000  hypothetical protein  25.06 
 
 		 399 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1033  hypothetical protein  25.06 
 
 		 399 aa  89.7  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3362  hypothetical protein  26.28 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2989  hypothetical protein  25.59 
 
 		 399 aa  87.8  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  23.76 
 
 		 810 aa  87.4  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  23.4 
 
 		 796 aa  86.7  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  23.19 
 
 		 804 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1021  protein of unknown function DUF214  25.18 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3339  hypothetical protein  25.18 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.59 
 
 		 882 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.6 
 
 		 849 aa  83.2  0.000000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  22.89 
 
 		 831 aa  79.7  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  24.32 
 
 		 805 aa  79.7  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.81 
 
 		 807 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  21.89 
 
 		 869 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.57 
 
 		 816 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.41 
 
 		 817 aa  73.9  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  25.12 
 
 		 817 aa  73.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  28.28 
 
 		 411 aa  72.4  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  19.85 
 
 		 805 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  23.3 
 
 		 415 aa  70.5  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.81 
 
 		 883 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  22.79 
 
 		 803 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  25.82 
 
 		 421 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  22.5 
 
 		 811 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  24.29 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  29.79 
 
 		 653 aa  67.4  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4417  putative ABC transporter, permease protein  24.09 
 
 		 830 aa  66.6  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.56334  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  21.31 
 
 		 814 aa  66.2  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  23.35 
 
 		 861 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.12 
 
 		 862 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.75 
 
 		 878 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  25.98 
 
 		 806 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  23.1 
 
 		 845 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22 
 
 		 813 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.41 
 
 		 809 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.81 
 
 		 807 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  28.5 
 
 		 805 aa  64.3  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  24.94 
 
 		 887 aa  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2598  protein of unknown function DUF214  21.57 
 
 		 813 aa  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.12 
 
 		 874 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  23.77 
 
 		 798 aa  63.2  0.000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  27.23 
 
 		 643 aa  63.2  0.000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  22.79 
 
 		 809 aa  62.4  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  24.08 
 
 		 809 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  24.27 
 
 		 798 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.13 
 
 		 893 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  25.26 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  20.83 
 
 		 805 aa  61.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  24.92 
 
 		 417 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3658  protein of unknown function DUF214  22.98 
 
 		 803 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0492574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  21.79 
 
 		 800 aa  60.1  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  23.08 
 
 		 656 aa  60.5  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  21.17 
 
 		 821 aa  60.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3520  protein of unknown function DUF214  27.08 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0642417  normal  0.207368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  23.88 
 
 		 844 aa  60.1  0.00000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4857  protein of unknown function DUF214  22.01 
 
 		 793 aa  59.7  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.586648  normal  0.220658 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.39 
 
 		 880 aa  59.7  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  21.45 
 
 		 809 aa  59.7  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  27.17 
 
 		 641 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  26.59 
 
 		 687 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  25.34 
 
 		 668 aa  59.7  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4844  protein of unknown function DUF214  24.06 
 
 		 793 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357668  normal  0.239545 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2757  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.56 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  23.19 
 
 		 887 aa  59.3  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.32 
 
 		 820 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  22.44 
 
 		 813 aa  59.3  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  22.36 
 
 		 770 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  23.12 
 
 		 777 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  27.17 
 
 		 641 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  25.34 
 
 		 668 aa  59.7  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  27.17 
 
 		 641 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4105  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 403 aa  58.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0276302 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  22.19 
 
 		 808 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  22.85 
 
 		 804 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  27.03 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5675  protein of unknown function DUF214  22.12 
 
 		 789 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  23.7 
 
 		 810 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  29.77 
 
 		 421 aa  58.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.73 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  24.19 
 
 		 806 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  25.66 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  26.84 
 
 		 681 aa  57  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>