More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_3258 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3690  ABC transporter, permease protein  91.98 
 
 		 399 aa  702    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0865  hypothetical protein  98.25 
 
 		 399 aa  803    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3157  hypothetical protein  98.25 
 
 		 399 aa  803    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3258  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  812    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3720  hypothetical protein  60.55 
 
 		 403 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1000  hypothetical protein  63.59 
 
 		 399 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1033  hypothetical protein  63.59 
 
 		 399 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1021  protein of unknown function DUF214  64.34 
 
 		 399 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0900  hypothetical protein  56.22 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.886297  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0725  hypothetical protein  59.75 
 
 		 398 aa  442  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3339  hypothetical protein  64.34 
 
 		 399 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2989  hypothetical protein  63.59 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2848  hypothetical protein  57.61 
 
 		 402 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4070  hypothetical protein  58.42 
 
 		 404 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3362  hypothetical protein  62.03 
 
 		 403 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2862  hypothetical protein  50.99 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2408  hypothetical protein  36.57 
 
 		 417 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2241  hypothetical protein  33.01 
 
 		 408 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3503  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.570589  normal  0.23151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0575  putative ABC transporter, permease protein  25.42 
 
 		 404 aa  126  6e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  24.52 
 
 		 831 aa  107  5e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  27.16 
 
 		 803 aa  105  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.96 
 
 		 862 aa  103  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  28.08 
 
 		 678 aa  102  8e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  26.89 
 
 		 647 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.74 
 
 		 678 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  27.74 
 
 		 678 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 		 407 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  27.21 
 
 		 649 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  27.39 
 
 		 410 aa  97.8  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  28.47 
 
 		 648 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  28.47 
 
 		 648 aa  97.8  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4455  protein of unknown function DUF214  29.6 
 
 		 395 aa  95.9  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  25.56 
 
 		 869 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  27.21 
 
 		 696 aa  94.7  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  25.19 
 
 		 805 aa  93.6  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.76 
 
 		 805 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  26.43 
 
 		 650 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  29.87 
 
 		 646 aa  90.9  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  24.02 
 
 		 647 aa  89.7  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.62 
 
 		 642 aa  90.1  7e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.12 
 
 		 913 aa  89.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.43 
 
 		 649 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  28.03 
 
 		 398 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.46 
 
 		 816 aa  89.4  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  27.27 
 
 		 641 aa  89.4  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  24.63 
 
 		 668 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  24.63 
 
 		 668 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  27.43 
 
 		 649 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  28.62 
 
 		 408 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.15 
 
 		 882 aa  87.8  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  24.71 
 
 		 802 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  25.87 
 
 		 640 aa  87.4  4e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.6 
 
 		 823 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 		 417 aa  86.7  6e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 		 421 aa  87  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  25.99 
 
 		 409 aa  86.7  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  25.07 
 
 		 810 aa  86.7  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.75 
 
 		 807 aa  86.7  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  24.63 
 
 		 648 aa  86.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.2 
 
 		 915 aa  86.3  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.2 
 
 		 820 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  24.74 
 
 		 656 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  23.81 
 
 		 682 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  25.69 
 
 		 653 aa  85.1  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  24.83 
 
 		 653 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  23.81 
 
 		 682 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  23.28 
 
 		 652 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  23.81 
 
 		 667 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  26.01 
 
 		 642 aa  84.3  0.000000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  22.64 
 
 		 796 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  25 
 
 		 798 aa  83.6  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  26.76 
 
 		 887 aa  84  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  24.13 
 
 		 400 aa  83.6  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  23.81 
 
 		 667 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  27.5 
 
 		 654 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.89 
 
 		 656 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  29.06 
 
 		 666 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.52 
 
 		 653 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.04 
 
 		 878 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.37 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  23.28 
 
 		 410 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.52 
 
 		 653 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.52 
 
 		 653 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  27.98 
 
 		 656 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  25.83 
 
 		 805 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 402 aa  82  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  23.49 
 
 		 814 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.95 
 
 		 648 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.95 
 
 		 648 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  25 
 
 		 809 aa  80.9  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  25.87 
 
 		 809 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.6 
 
 		 648 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  26.44 
 
 		 409 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.6 
 
 		 648 aa  80.9  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  25.66 
 
 		 408 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  23.71 
 
 		 808 aa  81.3  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 		 413 aa  80.9  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.95 
 
 		 648 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>