More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3362 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3362  hypothetical protein  100 
 
 		 403 aa  815    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3720  hypothetical protein  71.96 
 
 		 403 aa  553  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4070  hypothetical protein  69.8 
 
 		 404 aa  525  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3258  hypothetical protein  62.03 
 
 		 399 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0900  hypothetical protein  57.04 
 
 		 402 aa  444  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.886297  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3690  ABC transporter, permease protein  62.28 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2848  hypothetical protein  58.42 
 
 		 402 aa  436  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0725  hypothetical protein  58.81 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0865  hypothetical protein  63.03 
 
 		 399 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3157  hypothetical protein  63.03 
 
 		 399 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1000  hypothetical protein  60.79 
 
 		 399 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1033  hypothetical protein  60.79 
 
 		 399 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2862  hypothetical protein  52.58 
 
 		 405 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1021  protein of unknown function DUF214  61.79 
 
 		 399 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3339  hypothetical protein  61.79 
 
 		 399 aa  411  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2989  hypothetical protein  61.29 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2408  hypothetical protein  34.94 
 
 		 417 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2241  hypothetical protein  32.53 
 
 		 408 aa  216  7e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3503  protein of unknown function DUF214  32.82 
 
 		 405 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.570589  normal  0.23151 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0575  putative ABC transporter, permease protein  24.1 
 
 		 404 aa  115  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.06 
 
 		 816 aa  106  6e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3455  ABC transporter related  28.38 
 
 		 656 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.016844  normal  0.0104011 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0608  ABC transporter related  27.27 
 
 		 648 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0636  ABC transporter related  27.27 
 
 		 648 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1834  ABC transporter related  29.97 
 
 		 696 aa  96.3  8e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000402561  unclonable  0.00000000113397 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0821  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.96 
 
 		 656 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  28.27 
 
 		 682 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29 
 
 		 807 aa  95.5  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  24.77 
 
 		 831 aa  95.5  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  29.09 
 
 		 647 aa  95.5  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  28.27 
 
 		 682 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  28.98 
 
 		 667 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  28.27 
 
 		 667 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  26.68 
 
 		 803 aa  94.4  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  27.02 
 
 		 646 aa  94.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 		 406 aa  91.7  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  25.82 
 
 		 407 aa  90.5  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  27.09 
 
 		 649 aa  89.4  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  26.26 
 
 		 647 aa  87  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  25.69 
 
 		 817 aa  86.7  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  27.09 
 
 		 650 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  27.45 
 
 		 810 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  27.64 
 
 		 887 aa  84.7  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  29 
 
 		 678 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 		 401 aa  85.5  0.000000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  29 
 
 		 678 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29 
 
 		 678 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  24.91 
 
 		 640 aa  85.1  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  25.82 
 
 		 668 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  25.82 
 
 		 668 aa  85.5  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.1 
 
 		 820 aa  84.7  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  25.95 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  24 
 
 		 869 aa  84  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1792  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.36 
 
 		 653 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  24.62 
 
 		 805 aa  83.6  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  24.49 
 
 		 796 aa  83.6  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.64 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  27.11 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  25.76 
 
 		 821 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  26.03 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0835  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.81 
 
 		 653 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.077145  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2185  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.81 
 
 		 653 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  27.6 
 
 		 653 aa  80.9  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0926  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  25.81 
 
 		 653 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  23.14 
 
 		 652 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  24.09 
 
 		 802 aa  80.1  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  27.38 
 
 		 845 aa  80.1  0.00000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.72 
 
 		 855 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  27.05 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.89 
 
 		 893 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  25.56 
 
 		 409 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  23.49 
 
 		 814 aa  78.6  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  23.91 
 
 		 807 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.68 
 
 		 849 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  23.55 
 
 		 805 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 		 423 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  23.08 
 
 		 642 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  26.83 
 
 		 398 aa  77.8  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  25.52 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  26.35 
 
 		 802 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.05 
 
 		 649 aa  77.4  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  25.16 
 
 		 417 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  25.07 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  25.8 
 
 		 793 aa  77  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.62 
 
 		 805 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  29.58 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.89 
 
 		 913 aa  76.3  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  26.05 
 
 		 649 aa  76.3  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  24.42 
 
 		 657 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  25.61 
 
 		 809 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  23.81 
 
 		 642 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2453  ABC transporter related  26.37 
 
 		 676 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0759  macrolide-specific ABC-type efflux carrier  24.57 
 
 		 641 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.043367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6082  protein of unknown function DUF214  23.31 
 
 		 802 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  24.63 
 
 		 641 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  25.85 
 
 		 654 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  24.34 
 
 		 641 aa  74.7  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  24.48 
 
 		 797 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  23.93 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>