More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3503 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3503  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 405 aa  820    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.570589  normal  0.23151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2408  hypothetical protein  37.99 
 
 		 417 aa  264  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2862  hypothetical protein  35.51 
 
 		 405 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2241  hypothetical protein  32.35 
 
 		 408 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3258  hypothetical protein  34.47 
 
 		 399 aa  209  8e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3690  ABC transporter, permease protein  35.7 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3720  hypothetical protein  33.9 
 
 		 403 aa  203  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.49675 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0865  hypothetical protein  34.47 
 
 		 399 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3157  hypothetical protein  34.47 
 
 		 399 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0725  hypothetical protein  31.77 
 
 		 398 aa  193  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2848  hypothetical protein  32.04 
 
 		 402 aa  189  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0900  hypothetical protein  31.81 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.886297  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 399 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1000  hypothetical protein  33.33 
 
 		 399 aa  186  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2989  hypothetical protein  33.91 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4070  hypothetical protein  31.86 
 
 		 404 aa  179  9e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1021  protein of unknown function DUF214  33.17 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3339  hypothetical protein  33.17 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3362  hypothetical protein  33.74 
 
 		 403 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0575  putative ABC transporter, permease protein  24.76 
 
 		 404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  26.46 
 
 		 797 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.09 
 
 		 816 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  25.58 
 
 		 831 aa  94  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5613  protein of unknown function DUF214  23.98 
 
 		 388 aa  93.2  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  27.91 
 
 		 808 aa  87.8  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.81 
 
 		 805 aa  86.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  26.82 
 
 		 843 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.6 
 
 		 807 aa  80.1  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.4 
 
 		 807 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.71 
 
 		 862 aa  77.8  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  26.86 
 
 		 803 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3610  protein of unknown function DUF214  25.82 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.411205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2348  protein of unknown function DUF214  23.93 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.555804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  24.88 
 
 		 869 aa  75.9  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  25.67 
 
 		 809 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.53 
 
 		 817 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  24.08 
 
 		 796 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.67 
 
 		 817 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  25.43 
 
 		 802 aa  73.9  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  27.78 
 
 		 887 aa  73.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  24.7 
 
 		 814 aa  73.6  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  27.16 
 
 		 805 aa  73.2  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.4 
 
 		 884 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.91 
 
 		 913 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.12 
 
 		 878 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.88 
 
 		 880 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4622  protein of unknown function DUF214  21.7 
 
 		 802 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.498775 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.82 
 
 		 919 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  23.15 
 
 		 643 aa  70.1  0.00000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  24.29 
 
 		 802 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  23.02 
 
 		 816 aa  69.7  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  21.51 
 
 		 817 aa  69.7  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  25 
 
 		 861 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3505  ABC transporter, permease protein  24.92 
 
 		 804 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.084112  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  25.24 
 
 		 804 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.47 
 
 		 882 aa  69.3  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  23.26 
 
 		 642 aa  68.2  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  23.92 
 
 		 855 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  28.76 
 
 		 806 aa  68.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2937  ABC transporter related  24.18 
 
 		 668 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3444  ABC transporter related  24.18 
 
 		 668 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.625414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  27.42 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2156  protein of unknown function DUF214  23.89 
 
 		 797 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.777664  normal  0.702076 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3928  protein of unknown function DUF214  27.08 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  26.42 
 
 		 653 aa  67.4  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.86 
 
 		 813 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.59 
 
 		 893 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  22.34 
 
 		 770 aa  66.2  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  23.6 
 
 		 652 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  26.51 
 
 		 411 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0935  protein of unknown function DUF214  23.27 
 
 		 785 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4486  putative ABC transporter, permease protein  24 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433037 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0850  putative ABC transporter, permease protein  25.57 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0693  ABC transporter, permease  23.99 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  30.51 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  26.62 
 
 		 421 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0888  ABC transporter, permease protein, putative  26.39 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0758  ABC transporter permease  23.99 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0707  ABC transporter, permease  23.99 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  27.24 
 
 		 409 aa  64.7  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0797  ABC transporter permease  23.99 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  23.73 
 
 		 642 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.51 
 
 		 915 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0708  hypothetical protein  25.25 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  26.06 
 
 		 421 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  27.62 
 
 		 391 aa  64.3  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  25.3 
 
 		 647 aa  63.9  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  29.43 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.89 
 
 		 823 aa  63.5  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  32.03 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  21.8 
 
 		 794 aa  63.2  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  32.31 
 
 		 394 aa  63.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  24.85 
 
 		 808 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  22.77 
 
 		 809 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  22.06 
 
 		 804 aa  63.2  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0892  putative ABC transporter, permease protein  25.5 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.93003e-35 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1575  protein of unknown function DUF214  36.36 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000796219  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  24.79 
 
 		 643 aa  62.4  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>