73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0280 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0280  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 442 aa  916    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2348  protein of unknown function DUF214  21.63 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.555804  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  28.17 
 
 		 807 aa  61.2  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5613  protein of unknown function DUF214  18.81 
 
 		 388 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  26.45 
 
 		 1207 aa  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 		 809 aa  50.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 809 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  26.52 
 
 		 421 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  35 
 
 		 789 aa  50.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2089  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 794 aa  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0948  protein of unknown function DUF214  39.13 
 
 		 797 aa  49.3  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  29.03 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.8 
 
 		 878 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  25.22 
 
 		 855 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0939  protein of unknown function DUF214  38.03 
 
 		 770 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.709248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2206  protein of unknown function DUF214  41.18 
 
 		 777 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5431  protein of unknown function DUF214  28.35 
 
 		 800 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1804  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 		 802 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  28.23 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  27.27 
 
 		 1130 aa  47.8  0.0004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1460  hypothetical protein  23.94 
 
 		 415 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  25.63 
 
 		 852 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  24.48 
 
 		 395 aa  47.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2978  protein of unknown function DUF214  35.21 
 
 		 788 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.163424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6082  protein of unknown function DUF214  27.21 
 
 		 802 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5420  protein of unknown function DUF214  35.71 
 
 		 784 aa  47  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0066196  normal  0.0691461 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0430  hypothetical protein  28.57 
 
 		 884 aa  46.6  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4614  protein of unknown function DUF214  34.43 
 
 		 801 aa  46.6  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.122129 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2853  protein of unknown function DUF214  35.71 
 
 		 792 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  25.27 
 
 		 1090 aa  46.6  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  37.18 
 
 		 793 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4598  protein of unknown function DUF214  32.06 
 
 		 784 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.665219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  29.51 
 
 		 452 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4622  protein of unknown function DUF214  36.23 
 
 		 802 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.498775 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.32 
 
 		 807 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  25.67 
 
 		 800 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  24.16 
 
 		 863 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  21.63 
 
 		 800 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0958  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 		 797 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00075656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  26.8 
 
 		 794 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4621  protein of unknown function DUF214  31.36 
 
 		 791 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.158331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  23.68 
 
 		 806 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0929  protein of unknown function DUF214  32.86 
 
 		 791 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.790047 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4595  protein of unknown function DUF214  34.25 
 
 		 800 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  32.35 
 
 		 808 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1120  protein of unknown function DUF214  35.29 
 
 		 811 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00406203  normal  0.905875 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  22.97 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  24.39 
 
 		 804 aa  44.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  18.66 
 
 		 808 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4615  protein of unknown function DUF214  32.88 
 
 		 807 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.153317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0931  protein of unknown function DUF214  32.53 
 
 		 804 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0928  protein of unknown function DUF214  36.36 
 
 		 800 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1505  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.66 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1753  protein of unknown function DUF214  36.92 
 
 		 801 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  30.94 
 
 		 831 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0932  protein of unknown function DUF214  35.21 
 
 		 816 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  29.46 
 
 		 407 aa  43.9  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.82 
 
 		 874 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2178  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 		 790 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.424889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  25.23 
 
 		 818 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4617  protein of unknown function DUF214  33.82 
 
 		 792 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.214222 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7257  protein of unknown function DUF214  32.41 
 
 		 798 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.506744  normal  0.498638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4494  protein of unknown function DUF214  30.95 
 
 		 784 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0599884 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  22.99 
 
 		 885 aa  43.9  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00555  ABC transporter efflux protein  22.28 
 
 		 417 aa  43.5  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.29728  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0927  protein of unknown function DUF214  25.76 
 
 		 797 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.16153  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0697  protein of unknown function DUF214  23.16 
 
 		 401 aa  43.5  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3271  protein of unknown function DUF214  23.81 
 
 		 795 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.61861  normal  0.0322761 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  21.1 
 
 		 414 aa  43.1  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  28.46 
 
 		 443 aa  43.1  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.46 
 
 		 817 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4624  protein of unknown function DUF214  29.82 
 
 		 811 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  22.67 
 
 		 833 aa  43.1  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>