More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0478 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1857  ABC transporter related  44.46 
 
 		 885 aa  680    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0462324  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0236  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  44.43 
 
 		 950 aa  716    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  100 
 
 		 903 aa  1790    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27320  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  43.44 
 
 		 888 aa  625  1e-177  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  43.02 
 
 		 1090 aa  457  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3722  ABC transporter related  41.09 
 
 		 779 aa  427  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  40.15 
 
 		 1130 aa  423  1e-117  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  40.84 
 
 		 779 aa  421  1e-116  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26210  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  29.57 
 
 		 919 aa  342  2e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.443044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  68.44 
 
 		 1207 aa  319  1e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23530  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  25.56 
 
 		 893 aa  283  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000875217 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  39.24 
 
 		 643 aa  249  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  43 
 
 		 662 aa  240  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1856  ABC transporter related  44.67 
 
 		 660 aa  233  2e-59  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0748  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.83 
 
 		 664 aa  231  5e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  43.19 
 
 		 664 aa  229  2e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.96 
 
 		 246 aa  229  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  48.88 
 
 		 227 aa  223  9.999999999999999e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  49.33 
 
 		 230 aa  219  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  39.48 
 
 		 653 aa  218  5e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  49.55 
 
 		 224 aa  217  7e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  48 
 
 		 229 aa  217  8e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.85 
 
 		 230 aa  216  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  45.95 
 
 		 228 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  35.81 
 
 		 651 aa  212  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2457  ABC-type transport systems, involved in lipoprotein release, ATPase components  42.26 
 
 		 244 aa  213  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  46.67 
 
 		 232 aa  212  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 224 aa  212  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  43.69 
 
 		 242 aa  211  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 224 aa  211  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  48.2 
 
 		 224 aa  210  9e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  48.2 
 
 		 224 aa  210  9e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  48.2 
 
 		 224 aa  210  9e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 224 aa  210  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  46.4 
 
 		 247 aa  210  1e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 224 aa  210  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  48.2 
 
 		 224 aa  209  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  48.43 
 
 		 226 aa  209  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  48.65 
 
 		 224 aa  209  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  45.78 
 
 		 239 aa  208  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  46.19 
 
 		 236 aa  207  5e-52  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 		 233 aa  208  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  48.43 
 
 		 236 aa  207  7e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  38.87 
 
 		 642 aa  207  8e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  31.94 
 
 		 653 aa  207  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  48.2 
 
 		 240 aa  207  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  47.75 
 
 		 224 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.58 
 
 		 648 aa  206  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  46.85 
 
 		 225 aa  206  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  45 
 
 		 224 aa  206  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 		 226 aa  205  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 226 aa  204  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  45.5 
 
 		 226 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 226 aa  204  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 226 aa  204  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  45.5 
 
 		 226 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  45.95 
 
 		 242 aa  204  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 226 aa  204  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5049  ABC transporter related  45.05 
 
 		 226 aa  204  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.1 
 
 		 647 aa  204  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  45.5 
 
 		 226 aa  204  8e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  46.19 
 
 		 241 aa  203  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 226 aa  203  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  47.75 
 
 		 230 aa  203  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  46.4 
 
 		 260 aa  203  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  35.55 
 
 		 668 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  45.41 
 
 		 240 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  45.98 
 
 		 225 aa  201  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  45.91 
 
 		 254 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  47.19 
 
 		 230 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  36.77 
 
 		 671 aa  201  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  44.59 
 
 		 239 aa  201  7e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3705  ABC transporter related  45.91 
 
 		 293 aa  201  7e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  45.09 
 
 		 250 aa  201  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  46.19 
 
 		 236 aa  200  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  45.29 
 
 		 244 aa  200  7.999999999999999e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  43.4 
 
 		 246 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  38.56 
 
 		 642 aa  200  1.0000000000000001e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  44.34 
 
 		 237 aa  200  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1009  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.94 
 
 		 648 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.351129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1040  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.94 
 
 		 648 aa  199  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.38089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0977  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.59 
 
 		 648 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1060  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.59 
 
 		 648 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.964805  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  46.4 
 
 		 228 aa  198  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  44.84 
 
 		 229 aa  198  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000379324  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0943  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.59 
 
 		 648 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.483741  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  33.44 
 
 		 653 aa  199  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  45.29 
 
 		 225 aa  199  3e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  46.4 
 
 		 248 aa  198  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  37.37 
 
 		 652 aa  198  4.0000000000000005e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 		 226 aa  198  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  43.5 
 
 		 230 aa  198  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  44.59 
 
 		 233 aa  197  5.000000000000001e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2281  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  39.15 
 
 		 648 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000297537  normal  0.0300629 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1199  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 221 aa  197  6e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0191254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  36.54 
 
 		 660 aa  197  6e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1667  ABC transporter related  45.5 
 
 		 233 aa  197  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 		 233 aa  197  9e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2219  ABC transporter related  35.23 
 
 		 652 aa  197  9e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1543  ABC transporter related  45.09 
 
 		 234 aa  197  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.686883  normal  0.0297617 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>