142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2811 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  100 
 
 
422 aa  810    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  60.05 
 
 
400 aa  432  1e-120  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  59.71 
 
 
400 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  39.08 
 
 
398 aa  323  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  37.16 
 
 
414 aa  290  5.0000000000000004e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  37.41 
 
 
418 aa  260  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  29.22 
 
 
449 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  29.44 
 
 
423 aa  157  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  27.14 
 
 
419 aa  156  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  32 
 
 
417 aa  155  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  25.93 
 
 
414 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  54.49 
 
 
468 aa  153  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  30.33 
 
 
421 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  27.31 
 
 
410 aa  150  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.67 
 
 
419 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  30.02 
 
 
421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  29.93 
 
 
421 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  29.47 
 
 
421 aa  143  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  30.46 
 
 
421 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  30.46 
 
 
421 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  30.66 
 
 
421 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  30.22 
 
 
421 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  29.23 
 
 
421 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  25.36 
 
 
419 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  24.83 
 
 
446 aa  136  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  29.47 
 
 
421 aa  136  8e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  26.08 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  32.45 
 
 
421 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  29.51 
 
 
420 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  29.3 
 
 
421 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  29.31 
 
 
421 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  32.72 
 
 
431 aa  113  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  30.39 
 
 
425 aa  109  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  30.36 
 
 
424 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  25.46 
 
 
425 aa  100  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  30.84 
 
 
399 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  30.84 
 
 
399 aa  100  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  28.54 
 
 
425 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  35.59 
 
 
472 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  30.11 
 
 
420 aa  95.5  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  28.33 
 
 
420 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  34.84 
 
 
449 aa  93.2  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  26.73 
 
 
435 aa  92  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  30.8 
 
 
443 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2360  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.27 
 
 
411 aa  64.3  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.069448  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  24.77 
 
 
412 aa  59.7  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  21.92 
 
 
397 aa  55.8  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 
861 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.8 
 
 
415 aa  55.5  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  36.29 
 
 
838 aa  53.9  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  25.51 
 
 
402 aa  53.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  26.14 
 
 
386 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2385  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 
466 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  23.71 
 
 
402 aa  52.4  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2509  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.45 
 
 
414 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.418191  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  27.27 
 
 
488 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  30.46 
 
 
850 aa  52.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1693  peptide ABC transporter permease  29.81 
 
 
622 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.18804e-19 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  33.74 
 
 
775 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  26.69 
 
 
386 aa  50.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  23.49 
 
 
657 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  23.17 
 
 
404 aa  50.4  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  33.98 
 
 
849 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  23.18 
 
 
643 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  26.12 
 
 
414 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.12 
 
 
414 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  22.37 
 
 
663 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.91 
 
 
414 aa  48.9  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  34.23 
 
 
849 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2024  ABC transporter, permease component  28.89 
 
 
609 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.68 
 
 
415 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  34.02 
 
 
866 aa  47.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1365  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  29.41 
 
 
415 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  32.86 
 
 
662 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  20.89 
 
 
403 aa  47.8  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  22.37 
 
 
663 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3478  protein of unknown function DUF214  26.42 
 
 
402 aa  47.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1117  lipoprotein releasing system transmembrane  22.77 
 
 
416 aa  47.4  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0172186  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1076  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  29.63 
 
 
416 aa  47.4  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0609031  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4376  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.54 
 
 
437 aa  47.4  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.43 
 
 
418 aa  47  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3477  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  24.09 
 
 
422 aa  47  0.0007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5303  protein of unknown function DUF214  34.86 
 
 
830 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  24.24 
 
 
396 aa  46.6  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  22.38 
 
 
410 aa  46.6  0.0009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  29.93 
 
 
1207 aa  46.6  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  21.24 
 
 
397 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.56 
 
 
414 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299394  normal  0.273871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.67 
 
 
423 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1691  protein of unknown function DUF214  34.86 
 
 
295 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.132145  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  37.4 
 
 
386 aa  46.2  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5250  ABC transporter; permease  25.2 
 
 
617 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14690  Lipoprotein releasing system, hypothetical protein  29.32 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.319851  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4556  ABC transporter, permease  24.11 
 
 
634 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4797  ABC transporter; permease  24.41 
 
 
617 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191811  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 
387 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  31.15 
 
 
851 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  22.63 
 
 
654 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0960  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.15 
 
 
416 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1056  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  28.15 
 
 
416 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.504254 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>