More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1446 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 398 aa  807    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  45.52 
 
 		 414 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  40.55 
 
 		 400 aa  300  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  40.3 
 
 		 400 aa  293  5e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  43.54 
 
 		 418 aa  290  4e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  40.82 
 
 		 468 aa  289  7e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  38.83 
 
 		 422 aa  278  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 		 449 aa  166  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  26.47 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  26.79 
 
 		 421 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  27.36 
 
 		 421 aa  145  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  27.74 
 
 		 423 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  26.99 
 
 		 421 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  28.22 
 
 		 419 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  27.43 
 
 		 417 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  26.75 
 
 		 421 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  26.39 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  26.38 
 
 		 421 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.07 
 
 		 419 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  25.82 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  25.32 
 
 		 421 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  26.13 
 
 		 421 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  26.82 
 
 		 421 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  26.14 
 
 		 421 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  26.99 
 
 		 412 aa  124  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  26.98 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  23.89 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  27.78 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  26.04 
 
 		 410 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  26.87 
 
 		 399 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  26.87 
 
 		 399 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  23.93 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  26.43 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  22.43 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  24.77 
 
 		 443 aa  107  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  24.35 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  26.34 
 
 		 435 aa  103  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  31.51 
 
 		 472 aa  100  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  25.12 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  25.32 
 
 		 425 aa  96.3  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  32.35 
 
 		 449 aa  96.3  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  26.5 
 
 		 420 aa  94  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  27.09 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  26.86 
 
 		 431 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  26.14 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  26.14 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1763  putative ABC transporter, integral membrane protein  26.03 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.412712 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  25.85 
 
 		 422 aa  65.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  22.56 
 
 		 654 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  26.37 
 
 		 385 aa  61.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  22.92 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.97 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  23.3 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0795  ABC transporter, permease protein  36.67 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.372785  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  21.93 
 
 		 657 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3231  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.25 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113164  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5136  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.25 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433144  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.04 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  24.67 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0421  protein of unknown function DUF214  27.14 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  21.29 
 
 		 402 aa  57  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  24.15 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.41 
 
 		 422 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.29 
 
 		 424 aa  56.2  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3275  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.5 
 
 		 422 aa  56.2  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1041  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.65 
 
 		 427 aa  56.2  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0901467  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0317  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 422 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  19.7 
 
 		 656 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  22.87 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0371  putative ABC transporter, integral membrane protein  24.29 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.258896  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  20.99 
 
 		 663 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2428  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.16 
 
 		 426 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507047  normal  0.0670699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  22.87 
 
 		 427 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3478  protein of unknown function DUF214  25.66 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1787  protein of unknown function DUF214  25.93 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  21.45 
 
 		 654 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  24.33 
 
 		 422 aa  54.7  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.34 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  19.83 
 
 		 657 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  24.33 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.67 
 
 		 426 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  23.78 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1336  hypothetical protein  22.07 
 
 		 454 aa  54.3  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.420659  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1747  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.88 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.726619  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  23.18 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.25 
 
 		 417 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  21.45 
 
 		 663 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  23.08 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0446  integral membrane protein-permease component  22.15 
 
 		 373 aa  53.5  0.000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1389  hypothetical protein  25.46 
 
 		 379 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.89 
 
 		 417 aa  53.5  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  21.3 
 
 		 402 aa  53.1  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  27.91 
 
 		 775 aa  53.1  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4530  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.82 
 
 		 426 aa  52.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.42 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.172929  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  20.11 
 
 		 402 aa  52.4  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.1 
 
 		 427 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  21.84 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1684  ABC transporter related  21.62 
 
 		 656 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>