More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_11290 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  81.24 
 
 		 421 aa  685    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  82.42 
 
 		 421 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  78.15 
 
 		 421 aa  680    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  77.67 
 
 		 421 aa  680    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  96.67 
 
 		 421 aa  786    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  83.61 
 
 		 421 aa  729    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  81.47 
 
 		 421 aa  682    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  81 
 
 		 421 aa  684    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  100 
 
 		 421 aa  846    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  81.24 
 
 		 421 aa  684    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  79.46 
 
 		 421 aa  626  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  57.52 
 
 		 419 aa  488  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  59.9 
 
 		 421 aa  488  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  58.99 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  59.23 
 
 		 419 aa  479  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  54.57 
 
 		 417 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  52.98 
 
 		 420 aa  432  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  51.9 
 
 		 421 aa  428  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  55.61 
 
 		 425 aa  420  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  51.54 
 
 		 424 aa  410  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  48.69 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  44.28 
 
 		 414 aa  382  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  53.74 
 
 		 431 aa  378  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  44.63 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  50.12 
 
 		 425 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  42.96 
 
 		 412 aa  349  4e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  38.62 
 
 		 446 aa  316  5e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  26.63 
 
 		 414 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  30.4 
 
 		 449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  28.01 
 
 		 418 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  26.79 
 
 		 398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  29.35 
 
 		 400 aa  139  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  29.14 
 
 		 400 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  30.75 
 
 		 422 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  27.96 
 
 		 435 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  26.21 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  28.65 
 
 		 420 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  26.91 
 
 		 443 aa  99  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  40.91 
 
 		 468 aa  97.8  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  27.7 
 
 		 420 aa  94  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  25.88 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  25.88 
 
 		 399 aa  94.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  34.29 
 
 		 443 aa  69.3  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  34.29 
 
 		 452 aa  68.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  28.35 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  28.19 
 
 		 449 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  23.83 
 
 		 408 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1986  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25 
 
 		 418 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.914701  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  26.21 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  27.22 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.17 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  23.04 
 
 		 404 aa  59.7  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  25.15 
 
 		 407 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  30.25 
 
 		 408 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4297  hypothetical protein  27.35 
 
 		 420 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  23.91 
 
 		 404 aa  57.8  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5401  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.78 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  24.49 
 
 		 408 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  29.72 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.08 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  23.61 
 
 		 371 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.15 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  27.6 
 
 		 715 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  29.69 
 
 		 419 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.73 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.4 
 
 		 421 aa  55.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.85 
 
 		 414 aa  54.7  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  30.69 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3010  ABC transporter, permease protein  26.76 
 
 		 414 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0102949  hitchhiker  0.00186023 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1117  lipoprotein releasing system transmembrane  21.58 
 
 		 416 aa  53.9  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0172186  normal  0.243011 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  32.65 
 
 		 646 aa  53.9  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.5 
 
 		 418 aa  53.9  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0383  hypothetical protein  25 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  21.8 
 
 		 642 aa  53.5  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2927  protein of unknown function DUF214  32.14 
 
 		 409 aa  53.5  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.58384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.92 
 
 		 420 aa  53.5  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  23.01 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  25.62 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  26.3 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  24.64 
 
 		 385 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  24.46 
 
 		 404 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  32.85 
 
 		 488 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  23.16 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  35.85 
 
 		 838 aa  51.6  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2974  hypothetical protein  32.43 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.79 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  27.89 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2398  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.31 
 
 		 418 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0392  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 409 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.056313 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  36.59 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0960  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  20.69 
 
 		 416 aa  51.6  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0198  hypothetical protein  26.17 
 
 		 411 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.146044  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  22.9 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  30.08 
 
 		 851 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  28.87 
 
 		 416 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  28.87 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  28.49 
 
 		 847 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  24.01 
 
 		 408 aa  51.2  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  21.35 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  31.25 
 
 		 642 aa  51.2  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>