More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0704 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  851    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  56.9 
 
 
420 aa  494  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  54.87 
 
 
421 aa  462  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  57.28 
 
 
425 aa  452  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  55.79 
 
 
424 aa  451  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  48.69 
 
 
421 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  48.46 
 
 
419 aa  410  1e-113  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  47.74 
 
 
421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  47.74 
 
 
421 aa  402  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  48.22 
 
 
421 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  47.03 
 
 
421 aa  397  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  48.93 
 
 
421 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  49.02 
 
 
421 aa  395  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  48.78 
 
 
421 aa  393  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  47.97 
 
 
419 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  48.46 
 
 
419 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  49.51 
 
 
421 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  49.02 
 
 
421 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  47.99 
 
 
421 aa  390  1e-107  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  49.76 
 
 
421 aa  382  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  53.77 
 
 
431 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  48.32 
 
 
417 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  40.49 
 
 
414 aa  353  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  40.57 
 
 
410 aa  333  4e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  42.38 
 
 
425 aa  328  8e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  37.41 
 
 
412 aa  298  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  35.15 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  32.34 
 
 
400 aa  185  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  31.7 
 
 
400 aa  179  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  26.73 
 
 
414 aa  172  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  30.47 
 
 
449 aa  165  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 
398 aa  150  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  30.73 
 
 
422 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  27.16 
 
 
418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  27.93 
 
 
425 aa  111  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  27.23 
 
 
443 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  28.48 
 
 
399 aa  110  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  28.48 
 
 
399 aa  110  6e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  26.24 
 
 
435 aa  100  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  35.91 
 
 
468 aa  95.1  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  27.41 
 
 
420 aa  94.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  26.32 
 
 
420 aa  89.7  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  31.5 
 
 
472 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  30.48 
 
 
449 aa  84  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  22.06 
 
 
397 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  24.26 
 
 
371 aa  69.7  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  30.14 
 
 
385 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  32.62 
 
 
452 aa  63.2  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  22.7 
 
 
430 aa  63.2  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.31 
 
 
424 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 
378 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  23.18 
 
 
390 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  27.66 
 
 
443 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  28.18 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  21.56 
 
 
381 aa  60.1  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  24.59 
 
 
414 aa  59.7  0.00000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.66 
 
 
387 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  23.1 
 
 
386 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.46 
 
 
414 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  23.55 
 
 
409 aa  59.3  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.74 
 
 
439 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  28.57 
 
 
488 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.75 
 
 
421 aa  58.9  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3859  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.5 
 
 
416 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7003  protein of unknown function DUF214  20.54 
 
 
423 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00437024  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  24.92 
 
 
402 aa  57.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1714  hypothetical protein  23.02 
 
 
395 aa  57.8  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0633161 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  24 
 
 
400 aa  57.8  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1195  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.91 
 
 
439 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1065  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.91 
 
 
439 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.123078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  24.04 
 
 
405 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  24.04 
 
 
405 aa  57.4  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  23.81 
 
 
402 aa  57  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1541  hypothetical protein  23.48 
 
 
415 aa  56.6  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0147258 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  26.56 
 
 
408 aa  56.6  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25 
 
 
414 aa  56.6  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  25 
 
 
414 aa  56.6  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  23.34 
 
 
399 aa  56.6  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  23.02 
 
 
404 aa  55.8  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  25.27 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  25.65 
 
 
403 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4234  hypothetical protein  22.7 
 
 
410 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.496459  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.19 
 
 
414 aa  55.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  21.68 
 
 
387 aa  54.7  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2787  putative ABC transport system permease protein  23.46 
 
 
394 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000544033  hitchhiker  0.000418311 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  22.19 
 
 
414 aa  55.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0322  hypothetical protein  29.17 
 
 
393 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  29.86 
 
 
416 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  21.98 
 
 
408 aa  54.7  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  25.25 
 
 
385 aa  54.3  0.000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  25.74 
 
 
400 aa  54.3  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  22.2 
 
 
405 aa  53.9  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  24.67 
 
 
386 aa  53.9  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  25.35 
 
 
397 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.92 
 
 
420 aa  53.5  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.84 
 
 
420 aa  53.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0371  hypothetical protein  24.53 
 
 
414 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  29.51 
 
 
851 aa  52.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.02 
 
 
416 aa  53.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  23.08 
 
 
667 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>