63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3432 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  852    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  51.34 
 
 
421 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  50.98 
 
 
421 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  50.12 
 
 
421 aa  375  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  47 
 
 
419 aa  377  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  47.36 
 
 
421 aa  372  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  46.59 
 
 
419 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  50.62 
 
 
421 aa  371  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  50.37 
 
 
421 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  50.12 
 
 
421 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  50.37 
 
 
421 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  49.14 
 
 
421 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  45.61 
 
 
420 aa  359  7e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  45.85 
 
 
419 aa  357  2.9999999999999997e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  50.87 
 
 
421 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  50.62 
 
 
421 aa  353  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  48.4 
 
 
417 aa  349  5e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  49.14 
 
 
421 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  45.07 
 
 
421 aa  346  4e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  47.48 
 
 
425 aa  345  8.999999999999999e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  41.77 
 
 
414 aa  342  7e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  42.3 
 
 
410 aa  334  2e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  42.79 
 
 
423 aa  325  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  43.27 
 
 
424 aa  324  2e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  38.6 
 
 
446 aa  318  1e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  41.3 
 
 
412 aa  313  3.9999999999999997e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  46.09 
 
 
431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  28.97 
 
 
400 aa  133  5e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  28.31 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  25.47 
 
 
414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  27.44 
 
 
418 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  25.84 
 
 
449 aa  118  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  25.14 
 
 
398 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  26.87 
 
 
422 aa  102  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  27.3 
 
 
435 aa  99.8  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  26.86 
 
 
420 aa  93.6  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  31.34 
 
 
468 aa  89  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  24.07 
 
 
399 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  23.78 
 
 
399 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  24.12 
 
 
420 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  23.86 
 
 
443 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  22.33 
 
 
425 aa  73.6  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  29.9 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  22.92 
 
 
472 aa  57.4  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  24.05 
 
 
449 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  27.92 
 
 
412 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  24.66 
 
 
397 aa  47  0.0006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  23.34 
 
 
386 aa  46.6  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  24.04 
 
 
415 aa  46.2  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  22.13 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.9 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3824  hypothetical protein  30.3 
 
 
843 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.936763  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  22.9 
 
 
397 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  21.31 
 
 
406 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  23.33 
 
 
404 aa  44.3  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2015  hypothetical protein  30.85 
 
 
844 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.39 
 
 
424 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.81 
 
 
418 aa  44.3  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0418  protein of unknown function DUF214  22.75 
 
 
422 aa  44.3  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0611297 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  24.66 
 
 
397 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  35.63 
 
 
804 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0507  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.95 
 
 
427 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 
837 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>