91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6458 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  100 
 
 		 443 aa  851    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  60.95 
 
 		 435 aa  488  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  59.59 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  62.53 
 
 		 420 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  56.28 
 
 		 420 aa  389  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  48.2 
 
 		 472 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  48.88 
 
 		 449 aa  319  6e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 398 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  28.6 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  28.6 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  25.44 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  27.82 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  36.07 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  26.77 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  36.07 
 
 		 399 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  27.23 
 
 		 421 aa  106  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  28.89 
 
 		 449 aa  106  8e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  30.56 
 
 		 400 aa  106  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  26.14 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  26.91 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  25.5 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  23.41 
 
 		 446 aa  103  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  27.42 
 
 		 421 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  25.55 
 
 		 421 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  26.9 
 
 		 417 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  33.26 
 
 		 468 aa  102  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  25.34 
 
 		 419 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  24.43 
 
 		 410 aa  101  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  27.98 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  28.02 
 
 		 421 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  26.04 
 
 		 421 aa  94  4e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  29.95 
 
 		 400 aa  93.6  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  26.48 
 
 		 421 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  22.9 
 
 		 414 aa  91.3  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  23.41 
 
 		 419 aa  91.3  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  25.9 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  27.99 
 
 		 424 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  29.08 
 
 		 421 aa  87.4  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  27.54 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  24.76 
 
 		 418 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  24.84 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  26.04 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  27.7 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  30.26 
 
 		 431 aa  66.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  29.8 
 
 		 397 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1958  protein of unknown function DUF214  30.28 
 
 		 413 aa  52.8  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  38.46 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2296  protein of unknown function DUF214  27.78 
 
 		 392 aa  50.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0334  protein of unknown function DUF214  32.74 
 
 		 941 aa  50.4  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.530518  hitchhiker  0.0000549339 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  27.52 
 
 		 385 aa  50.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  22.46 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1024  hypothetical protein  21.8 
 
 		 402 aa  50.1  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.210647  normal  0.67232 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  32.65 
 
 		 399 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  35.97 
 
 		 853 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  28.21 
 
 		 389 aa  47.8  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  28.95 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  28.57 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  36.11 
 
 		 397 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  33.75 
 
 		 657 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  36.11 
 
 		 397 aa  47  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0653  hypothetical protein  31.73 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1506  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.51 
 
 		 412 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.746473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  30.23 
 
 		 903 aa  46.2  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2805  hypothetical protein  33.58 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.201922  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  25.65 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  30.72 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1101  hypothetical protein  47.06 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4287  protein of unknown function DUF214  34.62 
 
 		 420 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4309  protein of unknown function DUF214  35.09 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.965223  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  22.44 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  35.66 
 
 		 852 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  25.87 
 
 		 396 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  35 
 
 		 847 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4156  ABC transporter, inner membrane subunit  35.09 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0025  hypothetical protein  36.78 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01070  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  33.33 
 
 		 1207 aa  44.7  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  30.37 
 
 		 395 aa  43.9  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  34.31 
 
 		 651 aa  44.3  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.5 
 
 		 417 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  32 
 
 		 488 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2954  protein of unknown function DUF214  27.01 
 
 		 443 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0954365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  28.67 
 
 		 411 aa  43.9  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  33.33 
 
 		 664 aa  43.5  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2173  hypothetical protein  26.76 
 
 		 393 aa  43.9  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  29.24 
 
 		 387 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3231  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.5 
 
 		 422 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.113164  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5136  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.5 
 
 		 422 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.433144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  27.97 
 
 		 381 aa  43.1  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  26.71 
 
 		 792 aa  43.1  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  38.57 
 
 		 847 aa  43.1  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>