81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03782 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03782  putative permease  100 
 
 		 446 aa  905    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  47.52 
 
 		 410 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  45.07 
 
 		 412 aa  367  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  42.2 
 
 		 414 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  38.51 
 
 		 421 aa  329  8e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  39.46 
 
 		 421 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  39.55 
 
 		 419 aa  326  6e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  39.59 
 
 		 419 aa  325  9e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  38.29 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  38.96 
 
 		 421 aa  324  2e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  39.32 
 
 		 419 aa  322  7e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  38.74 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  38.11 
 
 		 421 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  37.99 
 
 		 421 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  39.86 
 
 		 421 aa  315  9.999999999999999e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  37.64 
 
 		 421 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  38.65 
 
 		 420 aa  312  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  39.19 
 
 		 421 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  40.4 
 
 		 421 aa  306  5.0000000000000004e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  37.18 
 
 		 421 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  38.57 
 
 		 421 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  38.6 
 
 		 425 aa  297  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  37.14 
 
 		 424 aa  296  5e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  37.73 
 
 		 417 aa  290  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  37.1 
 
 		 425 aa  282  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  34.68 
 
 		 423 aa  270  5e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  34.73 
 
 		 431 aa  219  7e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  27.43 
 
 		 449 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  26.74 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  27.87 
 
 		 468 aa  151  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  25.61 
 
 		 400 aa  145  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  25.85 
 
 		 400 aa  141  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 		 418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  24.01 
 
 		 398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  25.7 
 
 		 422 aa  117  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  25.69 
 
 		 472 aa  113  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  23.83 
 
 		 443 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  25.68 
 
 		 435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  25.68 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  24.4 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  24.93 
 
 		 449 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  24.49 
 
 		 425 aa  95.5  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 		 399 aa  89.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  24.88 
 
 		 399 aa  89.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  22.65 
 
 		 385 aa  62  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2173  hypothetical protein  25.97 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  23.45 
 
 		 429 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  22.94 
 
 		 429 aa  56.6  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  30.43 
 
 		 419 aa  52.8  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  27.91 
 
 		 387 aa  50.4  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  29.57 
 
 		 421 aa  50.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  22.31 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  25.66 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2138  ABC transporter, permease protein  22.17 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2248  hypothetical protein  22.17 
 
 		 430 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1519  protein of unknown function DUF214  30.34 
 
 		 379 aa  47  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1664  ABC transporter, permease protein, putative  29.63 
 
 		 424 aa  47  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.45663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  20.99 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0679  hypothetical protein  19.79 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0037  hypothetical protein  28 
 
 		 411 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.191885  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  27.07 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  32.88 
 
 		 853 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2399  protein of unknown function DUF214  28.69 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0296581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  32.28 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 		 452 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  26.53 
 
 		 402 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  20.16 
 
 		 467 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  25.89 
 
 		 394 aa  44.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1784  hypothetical protein  19.79 
 
 		 397 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.288295  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  27.33 
 
 		 367 aa  44.3  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  38.46 
 
 		 825 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1098  hypothetical protein  31.03 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0142755  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  28.8 
 
 		 418 aa  44.3  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  27.68 
 
 		 642 aa  43.9  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0652  hypothetical protein  25.37 
 
 		 393 aa  43.9  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  34.09 
 
 		 835 aa  43.5  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  27.73 
 
 		 833 aa  43.9  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2806  hypothetical protein  22.88 
 
 		 429 aa  43.5  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.398602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  35.53 
 
 		 816 aa  43.1  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  21.93 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1791  ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 394 aa  43.1  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>