69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3903 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  84.83 
 
 		 435 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 420 aa  825    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  67.06 
 
 		 425 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  62.53 
 
 		 443 aa  488  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  57.11 
 
 		 420 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  47.42 
 
 		 472 aa  348  8e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  45.87 
 
 		 449 aa  325  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  32.61 
 
 		 399 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  29.98 
 
 		 421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  29.98 
 
 		 421 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  32.61 
 
 		 399 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  28.95 
 
 		 421 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  28.88 
 
 		 421 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  29.8 
 
 		 449 aa  121  3e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  25.61 
 
 		 414 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  26.76 
 
 		 419 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  28.1 
 
 		 421 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  29.5 
 
 		 421 aa  112  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  25.78 
 
 		 410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  28.88 
 
 		 421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  27.45 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  26.25 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  26.09 
 
 		 419 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  28.74 
 
 		 417 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  23.18 
 
 		 446 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  28.65 
 
 		 400 aa  106  9e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  26.43 
 
 		 421 aa  106  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  25.65 
 
 		 398 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  26.81 
 
 		 421 aa  104  4e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  24.34 
 
 		 414 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  27.36 
 
 		 423 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  29.89 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  28.12 
 
 		 418 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  28.11 
 
 		 421 aa  100  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  29.5 
 
 		 421 aa  97.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  26.7 
 
 		 421 aa  96.3  9e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  26.2 
 
 		 420 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  27.39 
 
 		 425 aa  93.6  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  23.33 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  28.03 
 
 		 422 aa  90.9  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  30.09 
 
 		 468 aa  90.5  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  27.31 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  27.9 
 
 		 431 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  26.18 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  26.42 
 
 		 385 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2173  hypothetical protein  24.72 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  24.56 
 
 		 395 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0377  ABC transporter related  27.78 
 
 		 1130 aa  48.5  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.339238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0200  protein of unknown function DUF214  23.83 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  33.12 
 
 		 861 aa  48.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  27.23 
 
 		 390 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003048  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  32.8 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09490  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  34.13 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.457964  normal  0.625524 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0399  ABC transporter related  27.59 
 
 		 1090 aa  47.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.961547 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0478  ABC transporter related  30.65 
 
 		 903 aa  47  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0114283  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0774  protein of unknown function DUF214  32.26 
 
 		 1143 aa  46.6  0.0007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.66929  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1833  ABC transporter, permease protein  23.76 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1978  hypothetical protein  33.33 
 
 		 451 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00718973  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1152  protein of unknown function DUF214  25.51 
 
 		 833 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3503  protein of unknown function DUF214  40 
 
 		 405 aa  45.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.570589  normal  0.23151 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2021  ABC transporter, permease protein  23.76 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.18849  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  27.13 
 
 		 387 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  33.51 
 
 		 853 aa  45.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04780  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.26 
 
 		 427 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.531977  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1652  ABC transporter, permease protein  23.76 
 
 		 429 aa  45.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  33.6 
 
 		 488 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2454  protein of unknown function DUF214  29.63 
 
 		 792 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0184078  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.4 
 
 		 862 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2355  protein of unknown function DUF214  26.32 
 
 		 1016 aa  43.1  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>