116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3618 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 414 aa  838    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  62.77 
 
 		 418 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  45.52 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  40.69 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  39.68 
 
 		 400 aa  295  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  36.97 
 
 		 468 aa  265  8e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  38.91 
 
 		 422 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  26.65 
 
 		 421 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  26.65 
 
 		 421 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  29.31 
 
 		 449 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  26.73 
 
 		 423 aa  172  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  26.42 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  25.65 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  29.43 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 		 417 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 420 aa  163  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  27.87 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  27.87 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  27.59 
 
 		 421 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  26.78 
 
 		 421 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  26.99 
 
 		 421 aa  158  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  26.12 
 
 		 421 aa  157  4e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  27.4 
 
 		 419 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  26.07 
 
 		 419 aa  155  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  26.29 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  29.76 
 
 		 421 aa  152  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  26.68 
 
 		 419 aa  151  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  26.63 
 
 		 421 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  25.28 
 
 		 421 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  25.12 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  26.2 
 
 		 446 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  25 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  24.75 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  24.82 
 
 		 435 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  25.91 
 
 		 425 aa  123  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  25.99 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  25.99 
 
 		 399 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  27.36 
 
 		 431 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  26.19 
 
 		 420 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  24.55 
 
 		 443 aa  106  7e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  24.68 
 
 		 425 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  25.07 
 
 		 420 aa  100  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  25.58 
 
 		 472 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  25.78 
 
 		 449 aa  97.8  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  23.86 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  22.51 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  22.87 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  26.37 
 
 		 855 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  21.21 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  24.01 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.24 
 
 		 439 aa  53.5  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  23.22 
 
 		 836 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  23.44 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1646  hypothetical protein  22.2 
 
 		 396 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000328071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.91 
 
 		 420 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  22.74 
 
 		 407 aa  51.2  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  30.66 
 
 		 640 aa  51.2  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  22.07 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  23.28 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  24.67 
 
 		 399 aa  50.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  21.83 
 
 		 430 aa  50.1  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  22.07 
 
 		 422 aa  49.3  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1906  hypothetical protein  23.7 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000396781  hitchhiker  0.00508578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.92 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  23.16 
 
 		 409 aa  49.7  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  22.52 
 
 		 385 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1860  PglC  23.43 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000429042  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.39 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  21.95 
 
 		 378 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.21 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  24.35 
 
 		 841 aa  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05401  hypothetical protein  21.55 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  23.35 
 
 		 654 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  20.51 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  22 
 
 		 417 aa  47.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  24.65 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2404  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.16 
 
 		 438 aa  47  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.311939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  22.43 
 
 		 838 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  22.38 
 
 		 654 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2111  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  23.04 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.386264  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  26.11 
 
 		 849 aa  47  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  19.64 
 
 		 406 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  21.86 
 
 		 386 aa  46.6  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  21.59 
 
 		 407 aa  46.6  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  23.59 
 
 		 657 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  25.76 
 
 		 809 aa  46.6  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0277  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 		 431 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.19 
 
 		 857 aa  45.8  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  22.35 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0999  protein of unknown function DUF214  22.47 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00052376  normal  0.231875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  28.66 
 
 		 930 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  27.65 
 
 		 397 aa  45.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  21.68 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0204  hypothetical protein  22.04 
 
 		 388 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.20132  unclonable  0.000000000008111 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  20.62 
 
 		 865 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  21.27 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2173  hypothetical protein  20.82 
 
 		 393 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  21.77 
 
 		 415 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  20.98 
 
 		 825 aa  44.7  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  25.98 
 
 		 641 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>