82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1971 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  100 
 
 		 414 aa  841    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  46.1 
 
 		 421 aa  409  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  48.78 
 
 		 410 aa  410  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  46.1 
 
 		 421 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  47.68 
 
 		 419 aa  402  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  49.27 
 
 		 421 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  46.94 
 
 		 419 aa  398  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  46.23 
 
 		 421 aa  398  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  46.93 
 
 		 419 aa  395  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  44.86 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  44.61 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  44.86 
 
 		 421 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  44.28 
 
 		 421 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  44.63 
 
 		 421 aa  385  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  45.25 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  46.15 
 
 		 412 aa  369  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  44.36 
 
 		 421 aa  370  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  44.53 
 
 		 421 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  42.43 
 
 		 446 aa  357  1.9999999999999998e-97  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  41.71 
 
 		 417 aa  354  2e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  41.56 
 
 		 420 aa  347  2e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  40.49 
 
 		 423 aa  338  7e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  40.96 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  41.77 
 
 		 425 aa  330  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  43.75 
 
 		 425 aa  325  8.000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  39.23 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  38.92 
 
 		 431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  26.76 
 
 		 400 aa  158  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  24.73 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  26.29 
 
 		 449 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  27.27 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  25.77 
 
 		 418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  25.31 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  23.89 
 
 		 398 aa  124  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  32.76 
 
 		 468 aa  101  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  25.08 
 
 		 420 aa  93.2  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  24.31 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  23.24 
 
 		 443 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 435 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  22.03 
 
 		 399 aa  86.7  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  22.03 
 
 		 399 aa  86.3  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  22.2 
 
 		 425 aa  81.3  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  25.13 
 
 		 385 aa  77  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  23.59 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  23.71 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  22.34 
 
 		 430 aa  55.1  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  24.91 
 
 		 430 aa  55.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  23.3 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  22.86 
 
 		 410 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2006  hypothetical protein  26.75 
 
 		 395 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.151013  normal  0.929725 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  41.27 
 
 		 419 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  24.37 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  22.44 
 
 		 410 aa  50.8  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2497  hypothetical protein  25.42 
 
 		 422 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1669  hypothetical protein  36.9 
 
 		 421 aa  50.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  22.68 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  24.81 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  24.74 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  27.68 
 
 		 414 aa  46.6  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3474  protein of unknown function DUF214  25.48 
 
 		 399 aa  46.6  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0558  protein of unknown function DUF214  36.23 
 
 		 831 aa  46.2  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  23.82 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  25.44 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  23.54 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2736  ABC transporter permease protein  23.48 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  23.77 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1472  ABC transporter permease protein  25 
 
 		 417 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1555  protein of unknown function DUF214  22.78 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.386006  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  25.24 
 
 		 873 aa  44.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1376  hypothetical protein  22.19 
 
 		 386 aa  44.3  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  30.68 
 
 		 394 aa  44.3  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  20.6 
 
 		 462 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  21.82 
 
 		 847 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2282  ABC transporter, permease protein, putative  25 
 
 		 418 aa  43.5  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0229478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2859  hypothetical protein  22.88 
 
 		 423 aa  43.9  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0476  peptide ABC transporter ATPase  30.59 
 
 		 664 aa  43.5  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1668  hypothetical protein  35.06 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  35.59 
 
 		 838 aa  43.1  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  34.85 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1841  hypothetical protein  21.7 
 
 		 437 aa  43.1  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.521944  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  21.18 
 
 		 420 aa  43.1  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01130  putative ABC transporter  35.29 
 
 		 414 aa  42.7  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.95272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>