More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0681 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  84.8 
 
 		 421 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  84.09 
 
 		 421 aa  679    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  100 
 
 		 421 aa  854    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  96.2 
 
 		 421 aa  832    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  77.2 
 
 		 421 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  81.95 
 
 		 421 aa  689    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  88.84 
 
 		 421 aa  763    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  84.56 
 
 		 421 aa  706    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  84.32 
 
 		 421 aa  704    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  78.15 
 
 		 421 aa  680    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  77.02 
 
 		 421 aa  601  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  55.61 
 
 		 419 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  55.61 
 
 		 419 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  55.64 
 
 		 419 aa  455  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  54.65 
 
 		 421 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  54.33 
 
 		 417 aa  434  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  50.12 
 
 		 420 aa  407  1.0000000000000001e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  47.98 
 
 		 424 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  46.1 
 
 		 414 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  48.57 
 
 		 421 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  50.84 
 
 		 425 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  47.03 
 
 		 423 aa  381  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  51.34 
 
 		 425 aa  372  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  44.23 
 
 		 410 aa  367  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  51.4 
 
 		 431 aa  355  6.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  43.2 
 
 		 412 aa  347  3e-94  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  38.06 
 
 		 446 aa  324  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  28.53 
 
 		 414 aa  177  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  28.04 
 
 		 449 aa  163  5.0000000000000005e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  28.78 
 
 		 418 aa  151  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  28.68 
 
 		 400 aa  146  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  26.75 
 
 		 398 aa  139  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  28.03 
 
 		 400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  30.49 
 
 		 422 aa  125  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  25.64 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  25.59 
 
 		 443 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  25.79 
 
 		 420 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  37.66 
 
 		 468 aa  91.3  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  25.44 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  24.12 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  25.55 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1986  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.4 
 
 		 418 aa  63.9  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.914701  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1640  hypothetical protein  23.2 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1440  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.64 
 
 		 415 aa  62.4  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.141439  normal  0.211841 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  25.17 
 
 		 408 aa  62.4  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2095  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.82 
 
 		 421 aa  60.8  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00459774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1761  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.44 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  27.13 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 		 449 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0224  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  21.25 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0374875  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  30.13 
 
 		 387 aa  58.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  25.74 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  21.45 
 
 		 387 aa  56.6  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1210  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.33 
 
 		 418 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  31.25 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1252  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.61 
 
 		 414 aa  55.5  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.368874  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.14 
 
 		 420 aa  55.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2901  hypothetical protein  28.02 
 
 		 411 aa  55.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0934048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  22.26 
 
 		 390 aa  54.7  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  24.22 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  29.14 
 
 		 387 aa  54.3  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  31.29 
 
 		 443 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  28.17 
 
 		 640 aa  54.3  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 386 aa  53.9  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01125  ABC transporter, permease protein, putative  25.98 
 
 		 419 aa  53.5  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  27.36 
 
 		 404 aa  53.9  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0386  hypothetical protein  21.03 
 
 		 422 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.574376  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2669  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.15 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.32 
 
 		 420 aa  53.1  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  33.61 
 
 		 411 aa  53.1  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3474  protein of unknown function DUF214  26.98 
 
 		 399 aa  53.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5042  ABC transporter, permease protein, putative  23.39 
 
 		 415 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  25.38 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  28.24 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1172  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  20.18 
 
 		 416 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0830739  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1809  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolE  21.6 
 
 		 414 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  25.38 
 
 		 409 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0559  ABC efflux pump, inner membrane subunit  22.02 
 
 		 386 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00044398  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  22.76 
 
 		 404 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  25.7 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  25.38 
 
 		 409 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1066  protein of unknown function DUF214  31.78 
 
 		 840 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  22.76 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  23.16 
 
 		 407 aa  51.6  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 		 452 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  32.33 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0166  hypothetical protein  25.68 
 
 		 395 aa  51.6  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  24.66 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2156  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.53 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.775226  normal  0.0206091 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  26.67 
 
 		 412 aa  50.8  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0641  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  20.77 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.256103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.45 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  22.61 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  23.64 
 
 		 378 aa  51.2  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25 
 
 		 418 aa  50.8  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  24.48 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0481  lipoprotein releasing system transmembrane protein LolC  20.77 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1780  protein of unknown function DUF214  23.92 
 
 		 413 aa  50.4  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>