More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1965 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1965  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 449 aa  909    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1446  protein of unknown function DUF214  29.95 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.577785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2132  hypothetical protein  29.87 
 
 		 421 aa  179  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00772  hypothetical protein  29.46 
 
 		 419 aa  177  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11290  putative permease  30.4 
 
 		 421 aa  176  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4471  hypothetical protein  28.48 
 
 		 421 aa  176  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0681  permease, putative  28.04 
 
 		 421 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1563  protein of unknown function DUF214  28.85 
 
 		 420 aa  174  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5027  hypothetical protein  28.27 
 
 		 421 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5020  protein of unknown function DUF214  31.57 
 
 		 418 aa  172  9e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001701  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  28.82 
 
 		 419 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3618  protein of unknown function DUF214  29.78 
 
 		 414 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.198201  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1147  hypothetical protein  29.95 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0541  hypothetical protein  29.18 
 
 		 421 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0551  hypothetical protein  29.24 
 
 		 421 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0506  hypothetical protein  28.79 
 
 		 421 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0682613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0704  hypothetical protein  30.47 
 
 		 423 aa  158  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1037  putative lipoprotein  29.78 
 
 		 421 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.967071  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0426  predicted permease  26.99 
 
 		 419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3865  hypothetical protein  28.04 
 
 		 421 aa  156  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1679  hypothetical protein  28.82 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0559  hypothetical protein  29.24 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.641992 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03782  putative permease  26.12 
 
 		 446 aa  154  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1971  putative ABC transport system permease protein  27.01 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1825  hypothetical protein  29.13 
 
 		 424 aa  146  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0307  hypothetical protein  27.37 
 
 		 410 aa  145  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.682528  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1199  hypothetical protein  30.7 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0215661  normal  0.10586 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06630  ABC efflux transporter, permease protein  29.44 
 
 		 421 aa  143  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.949424  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2811  hypothetical protein  28.71 
 
 		 422 aa  142  9e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.597769  normal  0.679954 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2157  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 		 417 aa  141  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.710607 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3394  hypothetical protein  25.83 
 
 		 421 aa  137  3.0000000000000003e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453261  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1812  putative permease  26.43 
 
 		 412 aa  131  3e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.971161  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3303  hypothetical protein  28.84 
 
 		 399 aa  130  6e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.49953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3159  protein of unknown function DUF214  28.84 
 
 		 399 aa  130  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4227  protein of unknown function DUF214  29.85 
 
 		 435 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0571689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3557  hypothetical protein  28.54 
 
 		 425 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.159864 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3493  protein of unknown function DUF214  30.89 
 
 		 431 aa  119  9e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1292  hypothetical protein  29.69 
 
 		 420 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3432  hypothetical protein  25.74 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0608  permease component protein  29.09 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3903  protein of unknown function DUF214  29.16 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.171972 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6458  hypothetical protein  27.87 
 
 		 443 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.450145 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3917  hypothetical protein  26.64 
 
 		 472 aa  104  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4111  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962193  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1336  ABC transporter efflux protein  23.82 
 
 		 421 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1636  protein of unknown function DUF214  23.34 
 
 		 421 aa  70.5  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0989  ABC transporter efflux protein  23.31 
 
 		 404 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.150458  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  23.38 
 
 		 397 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  25.58 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  25.16 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  30.82 
 
 		 642 aa  67  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0999  protein of unknown function DUF214  33.77 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110671 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  25.6 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  31.16 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3108  hypothetical protein  24.7 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000183101  normal  0.613969 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  21.52 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  24.78 
 
 		 390 aa  64.7  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  32.5 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1534  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  27.04 
 
 		 642 aa  63.5  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  36.3 
 
 		 397 aa  63.2  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  27.27 
 
 		 640 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  29.41 
 
 		 641 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  23.53 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  23.31 
 
 		 643 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0710  macrolide-specific efflux protein macB  28.88 
 
 		 641 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  24.57 
 
 		 406 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  26.46 
 
 		 388 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  28.88 
 
 		 641 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1840  peptide ABC transporter ATPase  31.06 
 
 		 779 aa  62  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0302017 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  29.22 
 
 		 652 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  33.33 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  28.67 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  23.39 
 
 		 855 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3283  ABC transporter related  31.54 
 
 		 666 aa  60.5  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.477638  normal  0.90811 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  23.57 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  28.95 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  22.69 
 
 		 429 aa  60.1  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  31.03 
 
 		 647 aa  59.7  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  30.93 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.32 
 
 		 816 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1862  ABC transporter-related protein  30.95 
 
 		 646 aa  59.7  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0494  hypothetical protein  33.8 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.355429  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  31.44 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0184  hypothetical protein  27.82 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.430576  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  30.17 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0189  hypothetical protein  27.82 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0289  protein of unknown function DUF214  30.19 
 
 		 457 aa  58.2  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0996073  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7809  protein of unknown function DUF214  27.74 
 
 		 775 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  32.2 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  33.58 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  32.37 
 
 		 653 aa  58.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  29.32 
 
 		 429 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3535  ABC transporter related  29.66 
 
 		 682 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000291917  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  31.78 
 
 		 657 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0801  ABC transporter related  29.66 
 
 		 667 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00129194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0833  ABC transporter related  29.66 
 
 		 667 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.337791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  29.66 
 
 		 682 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>